Prevotella copri, bactérie commensale du microbiote intestinal : Etude de ses interactions avec les fibres alimentaires et impact sur la santé sur l'hôte.

Prevotella copri, a commensal bacterium of the intestinal microbiota: Study of its interactions with dietary fibers and its impact on host health.

• Auteur / Autrice : Julina Helle
• Direction : Claire Cherbuy
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Inscription en doctorat le 01/10/2024
• Etablissement(s) : université Paris-Saclay
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Agriculture, Alimentation, Biologie, Environnement, Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : MICALIS- Microbiologie de l'Alimentation au service de la santé humaine
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : UMR Micalis - Pôle Ecosystèmes- Equipe ProBihote Interactions des bactéries commensales et probiotiques avec l'hôte
• Partenaire(s) de recherche : Référent : Faculté des sciences d'Orsay

Mots clés

Mots clés libres

Microbiote intestinal

Santé digestive et métabolique

Fibres alimentaires

Intestinal microbiota

Digestive and metabolic health

Dietary fibers

Résumé

Le projet de thèse se concentre sur Prevotella copri, une bactérie du microbiote intestinal dont l'abondance est associée à une consommation élevée de fibres alimentaires. Cependant, les études rapportent des effets santé contradictoires : P. copri est parfois associée à des paramètres métaboliques positifs ou délétères. Notre objectif sera de contribuer : i/ à l'identification et la description de nouvelles souches de P. copri dans le microbiote de sujets sains consommateurs de fibres alimentaires ; ii/ de caractériser les interactions de ces souches avec des sucres complexes ; iii/ de mieux comprendre le rôle de P. copri, en interaction avec des fibres alimentaires, vis-à-vis de la santé métabolique de l'hôte. L'isolement de souches de P. copri se fera en utilisant des approches de culturomique et de métagénomique, à partir des selles de sujets consommant des fibres. L'étude du potentiel métabolique des souches de P. copri sera réalisée par métabolomique, en utilisant des sucres marqués au carbone-13. L'exploration des effets de P. copri, en association avec les fibres, sur la santé métabolique impliquera des modèles animaux gnotobiotiques, à microbiote simplifié contenant ou non P. copri, et recevant un régime riche en graisses. Ce travail permettra d'enrichir les connaissances sur P. copri, qui est une bactérie du microbiote intestinal altérée par le mode de vie occidental.

The thesis project focuses on Prevotella copri, a bacterium in the intestinal microbiota whose abundance is linked to a high consumption of dietary fibers. However, studies report contradictory health effects: P. copri is sometimes associated with positive or detrimental metabolic parameters. Our objectives are to: i/ identify and describe new strains of P. copri in the microbiota of healthy individuals with high fiber intake; ii/ characterize the interactions of these strains with complex sugars; iii/ better understand the role of P. copri, in interaction with dietary fibers, in host metabolic health. Isolation of P. copri strains will be conducted using culturomic and metagenomic approaches from the feces of fiber-consuming subjects. The study of the metabolic potential of P. copri strains will involve metabolomic, utilizing carbon-13-labeled sugars. Exploring the effects of P. copri, in association with fibers, on metabolic health will involve gnotobiotic animal models with a simplified microbiota containing or lacking P. copri, receiving a high-fat diet. This work will contribute to enhancing our understanding of P. copri, a bacterium in the intestinal microbiota altered by the Western lifestyle.