Caractérisation du profil moléculaire des microvésicules plasmatiques pour comprendre et phénotyper l'efficience alimentaire, la composition corporelle et la qualité de la viande des bovins

Characterisation of the molecular profile of plasma microvesicles to understand and phenotype feed efficiency, body composition and meat quality of bovines

• Auteur / Autrice : Vincent Prieur
• Direction : Isabelle Cassar-malek, Muriel Bonnet
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences et technologies de l'agriculture, de l'alimentation et de l'environnement
• Date : Inscription en doctorat le 01/01/2023
• Etablissement(s) : Université Clermont Auvergne (2021-...)
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : UMRH - Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores

Mots clés

Mots clés libres

Microvésicules

Phénotyper

Efficacité alimentaire

Composition corporelle

Qualité de viande

Bovin

Microvesicles

Phenotype

Feed efficiency

Body composition

Meat quality

Bovine

Résumé

Comprendre la construction des phénotypes de production des bovins et leur expression en système herbager est un enjeu de connaissance pour caractériser les systèmes agroécologiques et disposer de biomarqueurs pour du phénotypage. Au niveau international, des analyses omiques sont mises en œuvre pour décrypter plus particulièrement les mécanismes physiologiques contrôlant le phénotype d'efficience alimentaire et la composition corporelle chez les bovins. Toutefois, si les voies biologiques associées à ces phénotypes commencent à être décrites dans plusieurs tissus séparément, le dialogue entre les tissus qui contribuent à leur construction reste à caractériser. Les résultats de l'équipe identifient les exosomes (petites vésicules extracellulaires) comme des acteurs potentiels du dialogue physiologique régulant l'expression de ces phénotypes et comme une source potentielle de biomarqueurs. La thèse vise à caractériser les signatures moléculaires présentes dans les microvésicules circulantes (exosomes) et explicatives de l'efficience alimentaire ou de la composition corporelle chez des bovins croisés producteurs de viande élevés à l'herbe. Son programme repose sur l'hypothèse que l'intégration de signatures exosomales protéomiques et lipidomiques et de données phénotypiques permettra de caractériser les mécanismes mis en jeu dans ces phénotypes et identifier des biomarqueurs peu invasifs pour les caractériser.

Understanding the construction of bovine production phenotypes and their expression in grassland systems is a knowledge challenge for characterising agro-ecological systems and providing biomarkers for phenotyping. At the international level, omics analyses are being carried out to decipher the physiological mechanisms controlling the feed efficiency phenotype and body composition in cattle. However, while the biological pathways associated with these phenotypes are beginning to be described in several tissues separately, the dialogue between the tissues that contribute to their construction remains to be characterised. The team's results identify exosomes (small extracellular vesicles) as potential players in the physiological dialogue regulating the expression of these phenotypes and as a potential source of biomarkers. The thesis aims to characterise the molecular signatures present in circulating microvesicles (exosomes) that explain feed efficiency or body composition in grass-fed crossbred beef cattle. His programme is based on the hypothesis that the integration of proteomic and lipidomic exosomal signatures and phenotypic data will make it possible to characterise the mechanisms involved in these phenotypes and to identify minimally invasive biomarkers to characterise them.