Compréhension de l'effet des variables environnementales sur la survie et la croissance de Clostridium perfringens et Clostridioides difficile : Application au développement de procédés de décontamination dans les abattoirs

Understanding the effect of environmental variables on the survival and growth of Clostridium perfringens and Clostridioides difficile: Application to the development of decontamination processes in slaughterhouses

• Auteur / Autrice : Léa Savard
• Direction : Laurent Beney, Sébastien Dupont
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biotechnologies agro-alimentaires
• Date : Inscription en doctorat le 01/12/2022
• Etablissement(s) : Bourgogne Franche-Comté
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Environnements, Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Procédés Alimentaires et Microbiologiques
• Partenaire(s) de recherche : établissement de préparation : L'Institut Agro (Dijon ; 2022-....)

Mots clés

Mots clés libres

Décontamination

C. perfringens

C. difficile

Abattoirs

Lumière bleue

Humidité relative de l'air

Decontamination

C. perfringens

C. difficile

Slaughterhouse

Blue light

Relative air humidity

Résumé

Les microorganismes sont omniprésents dans l'environnement où leurs activités peuvent produire certains effets néfastes. Dans le cadre du développement durable de la production alimentaire, la maîtrise des microorganismes pathogènes constitue un enjeu majeur. En effet, la réduction de l'utilisation des agents antibiotiques et des biocides, délétères pour l'environnement, les animaux et les humains, impose le développement de stratégies ou de nouveaux procédés sains et efficaces. Ces procédés doivent en particulier mobiliser de faibles quantités d'énergie et ne pas recourir à des molécules à risque. Le sujet de thèse proposé s'intègre à l'ANR ClostAbat (Caractérisation des dangers Clostridium perfringens et Clostridioides difficile dans les filières bovine, porcine et volaille en abattoirs) portant sur la compréhension de la prévalence de ces microorganismes pathogènes dans différents types d'abattoirs (porcin, bœuf, volaille). L'ANR ClostAbat, pilotée par l'Anses, regroupe différents partenaires (Institut Pasteur, Institut Agro Dijon, Institut du Porc, Institut de l'élevage, Hôpital Saint-Antoine) dont les compétences complémentaires seront mises en œuvre sur le projet. Le travail de thèse sera articulé autour de la mise en œuvre de procédés visant à détruire ces microorganismes présents sur différentes surfaces contaminées dans les abattoirs (sol, mur, machines, outils). Le développement de ces procédés sera basé sur la compréhension de la réponse des microorganismes impliqués dans cette contamination à des perturbations environnementales 'naturelles' telles que les fluctuations de l'humidité de l'air et la lumière visible.

Microorganisms are ubiquitous in the environment where their activities can produce certain adverse effects. In the context of sustainable development of food production, the control of pathogenic microorganisms is a major issue. Indeed, the reduction of the use of antibiotic agents and biocides, which are deleterious to the environment, animals and humans, requires the development of strategies or new safe and effective processes. In particular, these processes must use small amounts of energy and not resort to risky molecules. The proposed thesis topic is part of the ANR ClostAbat (Characterization of the Clostridium perfringens and Clostridioides difficile hazards in the bovine, pig and poultry sectors in slaughterhouses), which focuses on the understanding of the prevalence of these pathogenic microorganisms in different types of slaughterhouses (pork, beef, poultry). The ANR ClostAbat, led by the Anses, brings together various partners (Institut Pasteur, Institut Agro Dijon, Institut du Porc, Institut de l'élevage, Hôpital Saint-Antoine) whose complementary skills will be used in the project. The thesis work will be articulated around the implementation of methods aiming at destroying these microorganisms present on various contaminated surfaces in slaughterhouses (ground, wall, machines, tools). The development of these methods will be based on the understanding of the response of the microorganisms involved in this contamination to 'natural' environmental disturbances such as fluctuations in air humidity and visible light.