Les longs ARN non codants dans la régulation des gènes soumis à l'impreinte génomique et dans la réponse au stress

Long non-coding RNAs in imprinted gene regulation and stress response

• Auteur / Autrice : Flavio Di michele
• Direction : Robert Feil
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie Santé
• Date : Inscription en doctorat le 01/09/2022
• Etablissement(s) : Université de Montpellier (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : IGMM - Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier

Mots clés

Mots clés libres

Régulation épigénétique

Long ARN non codant

Stress cellulaire

Epigenetic regulation

Long non-coding RNA

Cellular stress

Résumé

Les génomes des mammifères expriment des milliers de longs ARN non codants (‘lncRNAs'), dont les fonctions restent mal comprises. Les domaines de gènes soumis à l'empreinte génomique ont été instructifs pour mieux comprendre les rôles en cis des lncRNAs dans la structuration de la chromatine et dans l'expression génique. Le projet de thèse utilise des cellules primaires de la souris pour explorer un domaine soumis à l'empreinte impliqué dans le développement placentaire, musculaire et neural, et le focus sera sur un lncRNA transcrit du chromosome maternel. Des approches diverses seront développés pour identifier des domaines fonctionnels, les régions génomiques reconnus par le lncRNA, et en parallèle le projet explore les protéines nucléaires inter agissantes et leurs rôles. Appart du développement, d'une manière significative, le projet vise aussi à déchiffrer le rôle du lncRNA dans les réponses au stress, impliquant la voie P53 et d'autres pathways. Ce projet devrait augmenter notre compréhension de l'implication du lncRNA dans des maladies liées à l'empreinte et le cancer.

The mammalian genome expresses thousands of long non-coding RNAs (lncRNAs), the functions of which remain largely unknown. Imprinted gene loci have provided attractive model systems to explore the cis-regulatory roles of nuclear lncRNAs in chromatin organisation and in gene expression. This PhD project uses hybrid primary mouse cells to explore an essential imprinted gene domain that controls placental, muscle and brain development, with particular emphasis on a conserved nuclear lncRNA transcribed from the maternal chromosome. Diverse approaches will be developed to assess functional RNA domains, the precise regions in the genome controlled by the lncRNA, and nuclear interacting proteins and their functions. Besides developmental aspects, importantly, the project unravels the role of his lncRNA in stress responses that involve the P53 and other pathways. The proposed studies will enhance our understanding of the involvement of this lncRNA in human congenital diseases and cancer.