Thèse soutenue

Caractérisation des propriétés de surface, d’adhésion et de formation de biofilm de Parabacteriodes distasonis et étude de son interaction avec son hôte : du potentiel probiotique au pathogène opportuniste

FR  |  
EN
Auteur / Autrice : Jordan Chamarande
Direction : Catherine Cailliez-GrimalCorentine Alauzet
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences de la vie et de la santé
Date : Soutenance le 05/01/2023
Etablissement(s) : Université de Lorraine
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale BioSE - Biologie, Santé, Environnement
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Stress, immunité, pathogènes (Vandoeuvre-lès-Nancy)
Jury : Président / Présidente : Jean-Pierre Grill
Examinateurs / Examinatrices : Catherine Cailliez-Grimal, Corentine Alauzet, Benoît Foligné, Muriel Thomas, Alain Lozniewski
Rapporteurs / Rapporteuses : Jean-Pierre Grill, Benoît Foligné

Résumé

FR  |  
EN

Parabacteroides distasonis, bactérie à Gram négatif anaérobie stricte faisant partie du microbiote intestinal (MI), est décrite pour les propriétés bénéfiques qu’elle semble avoir pour son hôte. Parmi celles-ci, cette bactérie présente notamment des capacités anti-inflammatoires via la suppression de la production de cytokines pro-inflammatoires et des propriétés anti-cancéreuses via l’induction de l’apoptose des lignées cellulaires cancéreuses. Or P. distasonis est négativement impactée dans le MI par un stress chronique de l’hôte. Son utilisation en tant que nouveau produit biothérapeutique (NPB) semble être une piste intéressante.Cependant, d'autres données expérimentales décrivent P. distasonis davantage comme pathobionte de par son implication dans l’aggravation des pathologies inflammatoires telles que la colite chez la souris ou encore dans l’intensification des symptômes de la maladie de Charcot. Il semblerait donc que P. distasonis puisse avoir un rôle dichotomique dépendant du contexte, de l’environnement et possiblement de la souche. La façon dont cette bactérie colonise l’environnement compétitif qu’est l’intestin ainsi que les mécanismes à l'origine de son interaction avec son hôte restent cependant à l’heure actuelle mal connus.Ce projet a donc porté dans un premier temps sur l’étude des propriétés impliquées dans la colonisation et le maintien de P. distasonis au sein du tractus digestif (adhésion, formation de biofilm…). Dans un second temps, les structures de surface impliquées dans son interaction avec son hôte et pouvant expliquer son comportement bénéfique ou délétère ont été analysées in silico. Dans une troisième et dernière partie, les caractéristiques liées à la sélection de NPB d’un large panel de souches de P. distasonis ont été étudiées afin d’identifier un ou plusieurs candidats démontrant des effets bénéfiques pour l’hôte.Ce travail a permis de caractériser les principales propriétés de surface de P. distasonis impliquées dans son maintien au sein du MI et a confirmé que seules certaines souches de P. distasonis semblent prometteuses en tant que NBP. Cependant, leur utilisation nécessite de mieux définir les mécanismes sous-jacents à leurs interactions avec l’hôte, de s’assurer de leur survie jusqu’à la colonisation de leur lieu d’action et de l’absence d’effet indésirable pour l’hôte.