Les bactéries lactiques isolées d'aliments traditionnels marocains : production de bactériocines et applications potentielles contre des pathogènes multirésistants aux antibiotiques

Lactic acid bacteria isolated from traditional Moroccan foods : production of bacteriocins and potential applications against multidrug-resistant pathogens

• Auteur / Autrice : Kamar Amensag
• Direction : Saïd Ennahar, Rajae Belkhou
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie analytique
• Date : Soutenance le 18/09/2019
• Etablissement(s) : Strasbourg en cotutelle avec Université Sidi Mohamed ben Abdellah (Fès, Maroc)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut pluridisciplinaire Hubert Curien (Strasbourg ; 2006-....)
• Jury : Président / Présidente : Mohammed El Hassouni
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Saïd Ennahar, Rajae Belkhou, Mohammed El Hassouni, Catherine Perrin, Hassan Hajjaj, Amina Bouseta, Philippe André
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Catherine Perrin, Hassan Hajjaj, Amina Bouseta

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bactériocines

Résistance aux antibiotiques

Antibiotiques peptidiques

Aliments fermentés

Mots clés libres

Bactéries lactiques

Bactériocines

Antibiotiques

Bactéries multirésistantes aux antibiotiques

Lactic acid bacteria

Bacteriocins

Antibiotics

Multi-drug resistant bacteria

Résumé

L’antibiothérapie a permis de lutter efficacement contre nombre de maladies infectieuses, mais elle commence à atteindre ses limites avec l’émergence des microorganismes multi-résistants. La recherche de molécules alternatives est devenue une nécessité. Ce travail de thèse explore la possibilité d’utiliser des peptides antibactériens (bactériocines) produits par des bactéries comme moyen de lutter contre des bactéries résistantes. Des souches de bactéries lactiques productrices de bactériocines ont été isolées essentiellement à partir de divers produits alimentaires fermentés marocains. Les bactériocines produites ont été purifiées par des techniques chromatographiques, puis leurs structures ont été élucidées par spectrométrie de masse, par séquençage peptidique et/ou par séquençage nucléotidique. Ceci a permis l’identification d’une ou plusieurs bactériocines par bactérie productrice comme par exemple les entérocines L50A et L50B produites sous des formes modifiées par Enterococcus durans LC2 isolée du lait de chamelle. Parallèlement, une recherche de bactéries multi-résistantes aux antibiotiques dans des liquides biologiques humains a permis l’isolement de nombreuses bactéries pathogènes Gram+ et Gram- résistantes à une variété d’antibiotiques communément utilisés. Parmi celles-ci, des souches sélectionnées ont ensuite été soumises à l’action des bactériocines purifiées (entérocines L50A et L50B, nisine Z et pédiocine PA-1) seules et en association avec des antibiotiques. Ceci a permis de démontrer l’efficacité des bactériocines contre des pathogènes multi-résistants et par conséquent d’établir leur potentiel comme recours possible en cas d’inefficacité des antibiotiques.

Antibiotic therapy has been effective in controlling many infectious diseases, but is slowly reaching its limits with the emergence of multidrug-resistant microorganisms. The search for alternative molecules has become a necessity. This thesis explores the possibility of using antibacterial peptides (bacteriocins) produced by bacteria as a means to fight resistant bacteria. Strains of lactic bacteria producing bacteriocins have been isolated essentially from various fermented Moroccan foods. The bacteriocins produced were purified by chromatographic techniques, and their structures were elucidated by mass spectrometry, peptide sequencing and / or nucleotide sequencing. This allowed the identification of one or more bacteriocins per producing bacterium, e.g. enterocins L50A and L50B produced as modified forms by Enterococcus durans LC2 isolated from camel milk. At the same time, the search for multidrug-resistant bacteria in human body fluids has resulted in the isolation of pathogenic bacteria of both Gram types resistant to a variety of commonly used antibiotics. Among these, selected strains were subjected to the action of purified bacteriocins (enterocins L50A and L50B, nisin Z and pediocin PA-1) alone and in combination with antibiotics. This allowed us to show the efficacy of bacteriocins against multi-resistant pathogens, thereby demonstrating their potential as a possible alternative in case of antibiotic inefficiency.