Nouvelles plateformes moléculaires pour la reconnaissance optimisée de surfaces protéiques

New molecular plateforms for tailored recognition of protein surfaces

• Auteur / Autrice : Pierre-Thomas Skowron
• Direction : Julien Leclaire, Edith Norrant
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie organique
• Date : Soutenance le 24/04/2015
• Etablissement(s) : Ecole centrale de Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences Chimiques (Marseille ; 1996-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut des sciences moléculaires de Marseille (ISM2)
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Alexandre Martinez, Fréderic Fotiadu

Mots clés

Mots clés contrôlés

Protéines -- Modifications posttraductionnelles

Chimie combinatoire

Mots clés libres

Briques 1,4-dithiophénol-2,5-difonctionalisés

Dynarènes

Dynamique conformationnelle

1,4-dithiophenol-2,5-difunctionalized building blocks

Dynarènes

Conformational dynamic

Résumé

Depuis le début des années 1990, la chimie combinatoire dynamique a proposé une stratégie efficace pour la conception de nouveaux récepteurs spécifiques. En utilisant cette approche pour la reconnaissance de modifications post-traductionnelles de protéines, nous avons pu identifier par sérendipité puis isolé deux récepteurs potentiels d’acides aminés aromatiques, sensibles à la polarité du résidu le plus proche. Basés sur les conclusions de cette première étude, nous avons développé une nouvelle famille moléculaire d’analogues dynamiques polyfonctionnels des pillararènes : les dynarènes. Après avoir développé les voies de synthèse menant à l’obtention des briques constitutives, les premières études en chimie combinatoire dynamique nous ont permit de valider l’utilisation de ces briques pour la création de récepteurs multivalents, possédant une taille de la cavité ou de la couronne fonctionnelle optimale. En développant des synthèses efficaces à l‘échelle du gramme de ces nouveaux récepteurs moléculaires, nous avons enfin pu étudier la dynamique conformationnelle des objets.

Since the nineties, Dynamic Combinatorial Chemistry (DCC) has proven to be an efficient approach to design receptors capable of specific molecular recognition. Using this strategy for protein post-translational modification recognition, we serendipitously identified then isolated two potential aminoacids receptors, which are sensitive to the polarity of the nearest neighbor. On the basis of this preliminary study, we developed a new molecular family of multifunctional dynamic pillararene-like: the dynarenes. After the development of new synthetic routes to obtain constitutive building blocks, first studies in DCC allowed us to validate the use of such building blocks for multivalent receptor design, with optimized size and function. By developing efficient gramme-scale syntheses of new receptors, we study the conformational dynamics of the new compounds.