Etude de la diversité génétique d'Aspergillus fumigatus et de Chlamydophila psittaci chez les oiseaux et mise au point de modèles expérimentaux aviaires

Genetic diversity of Aspergillus fumigatus and Chlamydophila psittaci in birds and development of experimental avian models

• Auteur / Autrice : Simon Thierry
• Direction : Jacques Guillot
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 2011
• Etablissement(s) : AgroParisTech

Mots clés

Mots clés contrôlés

Aspergillus fumigatus

Aspergillose

Infections à Chlamydia

Oiseaux -- Maladies infectieuses

Mots clés libres

Chlamydophila psittaci

Résumé

Le champignon filamenteux Aspergillus fumigatus et la bactérie Chlamydophila psittaci sont deux agents pathogènes majeurs chez les oiseaux d'élevage. Bien que phylogénétiquement très distants, ces deux micro-organismes partagent un même mode de transmission par voie aérienne. La mortalité et la morbidité associées aux aspergilloses ou aux chlamydioses ont un impact économique qui n'est pas négligeable, en particulier dans les élevages de dindes. En France, les investigations autour de cas humains de chlamydiose identifient fréquemment un lien avec des élevages de canards, chez lesquels l'infection par C. Psittaci s'apparente à un portage intestinal asymptomatique. Pour analyser la circulation des agents pathogènes dans les élevages avicoles, nous avons tout d'abord étudié la diversité génétique d' Aspergillus fumigatus et de Chlamydophila psittaci. Pour cela, deux nouvelles méthodes de typage moléculaire MLVA (Multiple Locus VNTR Analysis) ont été mises au point. Ces méthodes se sont révélées très discriminantes, rapides et faciles à mettre en œuvre. Dans le cas d' A. Fumigatus, la méthode MLVA a permis de regrouper les génotypes en fonction de leur origine géographique. Elle a également permis d'analyser les modes de contamination d'un couvoir de dindes. Dans un second temps, nous avons analysé le pouvoir pathogène de ces deux microorganismes chez les oiseaux. Pour cela, deux modèles d'infections expérimentales ont été développés. Le premier modèle a permis de reproduire une aspergillose chez des poussins de 1 jour après inhalation d'un aérosol contenant des conidies d'A. Fumigatus. Lors de la mise au point du modèle, l'impact de l'immunodépression et de la lignée de poulet a été évalué. Pour C. Psittaci, un modèle reproduisant un portage intestinal de la bactérie chez des canetons mulards de 1 jour a été obtenu

The filamentous fungus Aspergillus fumigatus and the bacteria Chlamydophila psittaci are two major pathogens in poultry. Although phylogenetically distant, these two microorganisms share the same aerial transmission. Mortality and morbidity associated to aspergillosis and chlamydiosis are responsible for economic losses, in particular in turkey farms. In France, investigations on human cases of chlamydiosis frequently reveal a link with duck farms. The bacteria C. Psittaci is carried in the gut of ducks without any clinical signs. In order to investigate the circulation of Aspergillus fumigatus and Chlamydophila psittaci in avian farms, we studied the genetic diversity of the two pathogens. Two new MLVA (Multiple Locus VNTR Analysis) typing methods were set up. These methods revealed to be very discriminant, rapid and easy to use. In the case of A. Fumigatus, the MLVA method made it possible to cluster the genotypes according to their geographic origin. It also permitted the analysis of contamination modes in a turkey hatchery. In order to analyze the pathogenicity of Aspergillus fumigatus and Chlamydophila psittaci in birds, two experimental infection models were developed. The first model was designed to reproduce aspergillosis in one-day old chickens inoculated with airborne A. Fumigatus conidia. During this experiment, the impact of immunosuppression and of chicken lineage was evaluated. For C. Psittaci, a model reproducing an intestinal carriage of the bacteria in one-day old mule ducks was obtained