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Thèse en cours

Analyse des altérations structurales du génome dans la Leucémie Lymphoïde Chronique : apport de l’hybridation génomique comparative sur puces à ADN (CGH –array).

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AttentionLa soutenance a eu lieu le 04/11/2011. Le document qui a justifié du diplôme est en cours de traitement par l'établissement de soutenance.
Auteur / Autrice : Virginie Eclache
Direction : Florence Cymbalista
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie moléculaire
Date : Inscription en doctorat le 09/01/2007
Soutenance le 04/11/2011
Etablissement(s) : Paris 13
Ecole(s) doctorale(s) : Galilée

Résumé

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La leucémie Lymphoïde Chronique (LLC) est la plus fréquente des hémopathies occidentales. Les anomalies génétiques détectées par la technique d’hybridation in situ par fluorescence (FISH) ont une valeur pronostique bien établie. Dans ce travail, j ‘ai étudié les anomalies génétiques de la LLC à l’aide de plusieurs techniques. La FISH a été la méthode la plus sensible pour détecter la présence d’une délétion dans la région 1 3q14, ciblée sur le marqueur Dl 3 S3 1 9, dans 54% des cas d’une cohorte de 3 14 patients. La représentativité du clone variait de 7 à 90% ; le plus souvent monoallélique, la délétion portait sur les 2 allèles dans 9% des cas et des délétions mono- et bi-alléliques coexistaient dans 1 5% des cas. Nous avons réalisé une étude en Hybridation Génomique Comparative sur micro-puces recouvertes d’oligonucléotides (CGH-a) qui permet de quantifier les copies d’un gène sur l’ADN de patients par rapport à un témoin. Nous avons ainsi observé une grande variation de la taille de la délétion allant d’une région minimale, restreinte à une zone appelée BCMS comprenant les MicroARN 15 et 16, à une grande région de 60 M bases couvrant une zone allant du gène du Rétinoblastome à celui de la protocadherine. La CGH nous a également permis dans 3 cas, de mettre en évidence une délétion sur le chromosome 14, impliquant notamment le gène codant les immunoglobulines. Nous avons identifié un gène de fusion impliquant un nouveau partenaire : ZFP36LJ membre de la famille des tristétraprolines facteurs régulateurs de la transcription. Le rôle fonctionnel de ce nouveau transcript dans la leucémogenèse est en cours d’étude.