Analyse des facteurs environnementaux et anthropiques influençant les communautés d'espèces sauvages et l'émergence de maladies infectieuses

Environmental and Anthropogenic Factors Influencing Wildlife Communities and the Emergence of Infectious Diseases

• Auteur / Autrice : Beatrice Chataigner
• Direction : Julien Cappelle, Olivier Gimenez
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : BDI-Ecologie de la santé et Epidémiologie
• Date : Inscription en doctorat le 07/07/2025
• Etablissement(s) : Université de Montpellier (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : ASTRE - Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes

Mots clés

Mots clés libres

Chauve souris

Ecologie des communaute d'especes

Epidemiologie

Bat

Community ecology

Epidemiology

Résumé

Objectif Ce projet vise à étudier les facteurs environnementaux et anthropiques influençant les communautés de chauves-souris, ainsi que la manière dont les fluctuations de leur biodiversité peuvent impacter l'émergence de maladies infectieuses. La recherche se concentrera sur des agro-écosystemes situés dans trois hotspots de biodiversité : la Guinée, le Congo et le Cambodge. Méthodologie Ce projet de recherche développera un cadre standardisé permettant d'intégrer et d'analyser des données issues de pièges photographiques, d'enregistrements acoustiques et d'ADN environnemental (ADNe). Cette approche intégrative et multi-échelle permettra une analyse approfondie à différentes échelles spatiales, du niveau local (grotte) au paysage, tout en tenant compte des dynamiques spatiales et temporelles des interactions entre espèces jouant des rôles clefs dans la transmission de pathogènes.

PhD Overview This project aims to investigate the environmental and anthropogenic factors influencing bat communities, and how fluctuations in their biodiversity levels may drive the emergence of infectious diseases. The research will focus on three agroecosystem environments associated with cave systems located in biodiversity hotspots: Guinea, Congo, and Cambodia. Method This PhD will develop a standardized framework to integrate and analyze data from camera traps, acoustic recordings, and environmental DNA (eDNA). This integrative, multi-scale approach will enable comprehensive analysis from local (cave-level) to landscape-level spatial scales, accounting for both spatial and temporal dynamics of interactions among species having a key role in pathogen transmission.