Caractérisation de l'hétérogénéité du microenvironnement des polypes à risques : identification de biomarqueurs

Characterization of the microenvironment heterogeneity of high-risk polyps: Determination of novel blood-based biomarkers

• Auteur / Autrice : Nicolas Di gleria--pillard
• Direction : Caroline Bonnans
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie Santé
• Date : Inscription en doctorat le 30/09/2025
• Etablissement(s) : Université de Montpellier (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Signalisation, Plasticité et Cancer

Mots clés

Mots clés libres

Hétérogénéité

Inflammation

Biomarqueurs

Cancer du côlon

Biomarkers

Inflammation

Heterogeneity

Colorectal cancer

Résumé

Le cancer colorectal (CRC) est le 2ème cancer dans le classement des causes de décès dans le monde avec près de 1.8 millions de patients diagnostiqués chaque année. En général, plus on diagnostique le CRC à un stade précoce, meilleur est le pronostic. Bien que la détection des lésions précancéreuses et la polypectomie par coloscopie permettent de réduire significativement l'incidence du CRC, cette procédure est invasive, non plaisante, et présente un risque de complication lors de la résection des adénomes. Il y a donc un besoin médical de développer des méthodes de dépistage non invasives et d'identifier des biomarqueurs sanguins. Ce développement présente plusieurs avantages, non seulement de diagnostic pour sélectionner les personnes qui seraient susceptibles de bénéficier au mieux de la coloscopie mais également pour la stratification de risques afin d'affiner et d'individualiser les recommandations de dépistage. Aujourd'hui, il n'y a pas de biomarqueurs spécifiques qui permettent de différencier les polypes à faible risque de ceux à haut risque de progresser en CRC. L'hypothèse de ce projet est que l'hétérogénéité des adénomes pré-cancéreux, plus précisément l'infiltration inflammatoire associée à ces adénomes, pourrait permettre, si elle est bien caractérisée, de prédire leur progression en tumeur maligne. Grâce à l'utilisation de modèles in vitro, de modèles murins de tumorigenèse intestinale et d'échantillons humains, l'hétérogénéité des lésions pré-cancéreuses sera caractérisée de façon approfondie afin d'identifier un ou des biomarqueur(s) sanguins spécifiques de dépistage et/ou de prognostique de risque, qui permettront d'identifier les adénomes qui ont le potentiel de se transformer en cancer. De plus, cette caractérisation de l'hétérogénéité des adénomes sera appuyée par des analyses bio-informatiques sur des données du laboratoire mais aussi in silico à partir de données publiques. Ce projet est très pertinent en cancérologie à l'heure actuelle car d'après les cliniciens, il y a un réel besoin de trouver une méthode alternative de dépistage précoce qui sera rapide, non invasive, peu couteuse et qui pourra être utilisée sur une plus grande population, pour dépister un adénome douteux même chez des patients asymptomatiques.

Colorectal cancer (CRC) is a malignant disease with an incidence of over 1.8 million new cases per year worldwide. CRC outcome is closely related to the respective stage of CRC and is more favorable at less advanced stages. Detection of early colorectal adenomas is the key to survival. In spite of reduction of colorectal cancer (CRC) incidence by the early detection of precancerous adenoma and polypectomy by colonoscopy, this procedure is very invasive, unpleasant for the patient and not without risk during the resection of adenomas. Thus, there is a need to find non-invasive detection methods and blood-based biomarkers are very advantageous, not only for the diagnostic and for the selection of people who will be susceptible to benefit from colonoscopy, but also for the stratification of risk to individualize the recommendations of screening. Today there is no specific biomarkers that allow the differentiation between low risk from high-risk adenomas to progress into CRC. The hypothesis of this project is that heterogeneity of pre-cancerous adenoma, in particular the infiltrated inflammation, could allow the prediction of their progression or not into CRC. With the use of in vitro models, mouse models of intestinal tumorigenesis and human adenoma samples, the molecular heterogeneity will be deeply characterized in order to identify one or several specific blood biomarkers of detecting and/or risk prognostic, that could differentiate adenoma that have the potential to progress or not into CRC. Also, computational analyses will be performed on RNA sequencing data but also in silico on public database to support our project. This project is a translational project and could have a real impact in oncology since a non-invasive, cheap alternative method is needed to detect early lesion on a broader asymptomatic population.