Répression des éléments transposables : Exploration de la diversité génétique dans les interactions blé-Zymoseptoria tritici comme voie vers un meilleur contrôle de la Septoriose.

Repression of transposable elements: Exploring gene diversity in wheat-Zymoseptoria tritici interactions as a path to improval Septoria tritici blotch control.

• Auteur / Autrice : Clémentine Langlet
• Direction : Thierry Marcel, Ludovic Bonhomme
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences végétales
• Date : Inscription en doctorat le 01/07/2025
• Etablissement(s) : université Paris-Saclay
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences du Végétal : du gène à l'écosystème
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : BIOlogie GEstion des Risques en agriculture
• Partenaire(s) de recherche : Référent : Faculté des sciences d'Orsay

Mots clés

Mots clés libres

Diversité allélique

Intéraction gène-pour-gène

Génétique d'association

Pathologie végétale

Allelic diversity

Gene-for-gene interaction

Association genetics

Plant pathology

Résumé

La septoriose, causée par le champignon Zymoseptoria tritici, est une des principales maladies du blé en Europe entrainant des pertes importantes voire très importante chaque année. L'un des principaux moyen de lutte contre cette maladie, respectueux de l'environnement et de la société, est l'utilisation de variétés de blé résistantes. A ce jour, 23 gènes de résistance appelés gènes Stb ont été identifiés et plusieurs centaines de QTL de résistance. Ces gènes fonctionnent selon la relation gène-à-gène, ce qui signifie qu'ils reconnaissent la présence directe ou indirecte du produit du gène d'avirulence correspondant du champignon. Il existe peu de données sur les spécificités de reconnaissance entre produits des gènes Stb et AvrStb. Le projet de thèse propose pour plusieurs couples Stb/AvrStb connus d'étudier leurs diversités alléliques et la spécificité d'interaction entre ces allèles. Ces résultats permettront à long terme de mieux appréhender l'utilisation des allèles de résistance dans les variétés cultivées en fonction des allèles d'avirulence présents dans les populations de Z. tritici.

Septoria tritici blotch, caused by Zymoseptoria tritici fungus, is one of the main wheat diseases in Europe, leading to significant losses every year. One of the main environmentally and socially-friendly ways of controlling this disease is to use resistant wheat varieties. To date, 23 resistance genes known as Stb genes have been identified, along with several hundred resistance QTLs. These genes operate on a gene-for-gene relationship, which means that they recognize the direct or indirect presence of the corresponding avirulence gene product of the fungus. Little is known about the specificities of recognition between Stb and AvrStb gene products. This thesis project proposes to study the allelic diversity and interaction specificity of several known Stb/AvrStb pairs. In the long term, these results will provide a better understanding of the use of resistance alleles in cultivated varieties, depending on the avirulence alleles present in Z. tritici populations.