Connaissance et biocontrôle du ou des agents pathogènes responsables de la pourriture de la châtaigne

Knowledge and biocontrol of the pathogen(s) responsible for chestnut rot

• Auteur / Autrice : Luana Leymarie
• Direction : Patrice Rey, Mickael Le bechec
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie des organismes
• Date : Inscription en doctorat le 01/04/2025
• Etablissement(s) : Pau
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences Exactes et leurs Applications
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut des sciences analytiques et de Physico-chimie pour l'Environnement et les Matériaux

Mots clés

Mots clés libres

Maladies fongiques

Châtaignes

Diagnostic

Biocontrôle

Fungal diseases

Chestnut

Diagnostic

Biocontrol

Résumé

Depuis plusieurs décennies, la production de châtaignes en France connaît une baisse drastique, passant de 80 000 tonnes en 1965 à seulement 8 000 tonnes en 2023. Cette chute est aggravée par des pertes sanitaires significatives, qui peuvent atteindre plus de 50% des volumes récoltés, obligeant la France à importer plus de 20 000 tonnes de châtaignes chaque année pour répondre à la demande. Parmi les principales causes de ces pertes figure une recrudescence des pourritures des fruits observée depuis le début des années 2000 en Europe, en particulier celles causées par le champignon pathogène Gnomoniopsis castaneae. Ce pathogène est difficile à détecter, car il infecte l'amande du fruit tout en laissant l'écorce extérieure apparemment intacte. Le projet de recherche proposé vise à réduire de 50% les pertes dues à ces pourritures en verger. Deux axes majeurs seront développés : Dans un premier temps le développement d'un outil moléculaire pour détecter et quantifier le ou les agents pathogènes impliqués dans la pourriture des châtaignes. Ce travail permettra également de modéliser leur épidémiologie afin d'optimiser les pratiques agricoles et les stratégies de traitement (phytosanitaire ou biocontrôle). Dans un second temps, la recherche de solutions de biocontrôle par un criblage de la microflore naturelle de la châtaigne sera réalisé afin d'identifier de nouveaux microorganismes de biocontrôle, adaptés au contexte spécifique des vergers de châtaigniers, pour des applications préventives (avant récolte) et curatives (pendant le stockage), et les comparer aux produits de biocontrôle déjà disponibles.

Over the last few decades, chestnut production in France has fallen drastically, from 80,000 tonnes in 1965 to just 8,000 tonnes in 2023. This decline has been exacerbated by significant health losses, which can amount to more than 50% of the volume harvested, forcing France to import more than 20,000 tonnes of chestnuts every year to meet demand. One of the main causes of these losses is fruit rot observed since the early 2000s in Europe, particularly those caused by the pathogenic fungus Gnomoniopsis castaneae. This pathogen is difficult to detect, as it infects the kernel of the fruit while leaving the outer rind apparently intact. The aim of the proposed research project is to reduce losses due to this rot in orchards by 50%. The project will focus on two main areas: Firstly, the development of a molecular tool to detect and quantify the pathogen(s) involved in chestnut rot. This work will also enable their epidemiology to be modelled in order to optimise agricultural practices and treatment strategies (phytosanitary or biocontrol). Secondly, biocontrol solutions will be sought by screening the chestnut's natural microflora in order to identify new biocontrol microorganisms, adapted to the specific context of chestnut orchards, for preventive (pre-harvest) and curative (during storage) applications, and compare them with biocontrol products already available.