Une approche multi-omique pour étudier les mécanismes de biosynthèse des toxines chez la microalgue Gambierdiscus polynesiensis

A multi-omics approach to study toxin biosynthesis mechanisms in the microalga Gambierdiscus polynesiensis

• Auteur / Autrice : Kehau-Lani Feral
• Direction : Hélène Taiana Darius, Guillaume Mitta
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie des organismes ; Biochimie et biologie moléculaire
• Date : Inscription en doctorat le 11/09/2024
• Etablissement(s) : Polynésie française
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale du Pacifique (Faaa)

Mots clés

Mots clés libres

Ciguatéra

Gambierdiscus polynesiensis

Ciguatoxines

Production et profils toxiniques

Métabolome

Microbiome

Transcriptome

Approche multi-omique

Ciguatera

Gambierdiscus polynesiensis

Ciguatoxins

Production and toxin profile

Metabolome

Microbiome

Transcriptome

Multi-omique approach

Résumé

A ce jour, les voies de biosynthèse des toxines chez la microalgue Gambierdiscus, agent causal de la ciguatéra, expliquant les différences de production toxinique entre les souches et les espèces sont peu connues. Le projet de thèse ''Ciguatoxomics'' vise à étudier ces mécanismes en analysant la toxicité, les profils toxiniques, ainsi que les données du transcriptome, du métabolome et du microbiome de différentes souches de Gambierdiscus polynesiensis. Le projet se divise en deux volets : le premier consiste à évaluer la toxicité et les profils toxiniques complet des souches d’origine géographique variée cultivées dans des conditions standardisées; le second explore les voies de biosynthèse des toxines en utilisant une approche multiomique, afin d'identifier les mécanismes impliqués dans la synthèse des toxines en examinant notamment le rôle potentiel du microbiome.

To date, little is known about the toxin biosynthetic pathways in the microalga Gambierdiscus, causal agent of ciguatera, that explain the differences in toxin production between strains and species. The ''Ciguatoxomics'' PhD project aims to investigate these mechanisms by analyzing the toxicity, toxin profiles, as well as transcriptome, metabolome, and microbiome data from various strains of Gambierdiscus polynesiensis. The project is divided into two parts: the first part involves evaluating the toxicity and complete toxin profiles of strains of varied geographical origin grown under standardized conditions; the second part investigates the toxin biosynthesis pathways using a comparative multi-omics approach, in order to identify the mechanisms involved in toxin synthesis, examining in particular the potential role of the microbiome.