Thioaptamères Ciblant les Petites Molécules d'Intérêt Médical: Nouvelles Opportunités en Bioanalyse

Thioaptamers Targeting Small Molecules of Medical Interest: New Opportunities in Bioanalysis

• Auteur / Autrice : Amandine Barbaroux
• Direction : Eric Peyrin, Corinne Ravelet
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences du Médicament
• Date : Inscription en doctorat le 01/10/2024
• Etablissement(s) : Université Grenoble Alpes
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale chimie et science du vivant
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Département de Pharmaco chimie Moléculaire

Mots clés

Mots clés libres

Diagnostic

Interactions

Bioanalyse

Phosphorothiate

Aptamère

Aptamer

Diagnostic

Interactions

Phosphorothiate

Bioanalysis

Résumé

Le dosage de petites molécules en biologie médicale (hormones, toxines, biomarqueurs) repose souvent sur des techniques d'immunoanalyse. Cependant, les anticorps présentent un certain nombre d'inconvénients, notamment une propension à la dénaturation dans certaines conditions expérimentales et une reproductibilité incertaine d'un lot à l'autre. D'autres outils de reconnaissance moléculaire, les aptamères oligonucléotidiques, sont apparus avec l'émergence d'appareils commerciaux performants pour le dosage des protéines (Somascan, par exemple, qui peut doser plusieurs milliers de protéines simultanément). Malheureusement, les aptamères dirigés contre des petites molécules ont eu beaucoup moins de succès en bioanalyse, principalement en raison du fait que les aptamères ont une affinité beaucoup plus faible que celle des anticorps. Dans ce projet, nous proposons d'identifier de nouveaux aptamères ayant des propriétés de reconnaissance accrues pour les petites cibles au moyen d'une simple modification de leur squelette (substitution de la liaison phosphodiester par une liaison phosphorothioate). Cette approche devrait également améliorer la biostabilité des aptamères dans les milieux biologiques.

The assay of small molecules in medical biology (hormones, toxins, biomarkers) is often based on immunoassay techniques. However, antibodies have a number of drawbacks, including a propensity for denaturation under certain experimental conditions and uncertain batch-to-batch reproducibility. Other molecular recognition tools, oligonucleotide aptamers, have appeared with the emergence of high-performance commercial protein assay devices (Somascan, for example, which can assay several thousand proteins simultaneously). Unfortunately, aptamers directed against small molecules have been much less successful in bioanalysis, mainly due to the fact that aptamers have a much lower affinity than antibodies. In this project, we propose to identify new aptamers with enhanced recognition properties for small targets by means of a simple modification of their backbone (substitution of the phosphodiester bond by a phosphorothioate bond). This approach should also improve the biostability of aptamers in biological media.