ExoFFF : méthodologie multidimensionnelle de fractionnement par couplage flux force pour l'investigation et la définition des biomarqueurs d'agressivité exosomaux en oncologie.

ExoFFF: multidimensional field-flow fractionation methodology for the investigation and definition of exosomal biomarkers of aggressiveness in oncology

• Auteur / Autrice : Damien Ott de nussac
• Direction : Gaelle Begaud, Gaetane Lespes
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie Chimie Santé mention Immunologie, oncologie, inflammation, infectiologie
• Date : Inscription en doctorat le 15/09/2024
• Etablissement(s) : Limoges
• Ecole(s) doctorale(s) : Biologie, Chimie, Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Contrôle de l'Activation cellulaire, Progression Tumorale et Résistance thérapeutique

Mots clés

Mots clés libres

Vésicules extracellulaires

Fractionnement par couplage Flux Force

Biomarqueurs

Tumeurs cérébrales

Méthodes analytiques

Sciences séparatives

Extra-cellular vesicles

Brain tumors

Field-Flow Fractionation

Biomarkers

Analytical methods

Separation sciences

Résumé

Le glioblastome (GB) est une tumeur de haut grade pour laquelle il n'existe actuellement aucun traitement curatif. Leur prise en charge thérapeutique reste complexe puisque ces tumeurs finissent toujours par échapper, à plus ou moins court terme, aux premières lignes de traitement. Les cellules tumorales et en particulier les cellules souches cancéreuses (CSCs) sont en partie responsables de ces échappements ainsi que des récidives. Ces cellules sécrètent des vésicules extra-cellulaires (VEs) à haut potentiel d'agressivité parmi lesquelles, des exosomes, qui assurent la dissémination tumorale et augmentent la résistance thérapeutique du GB. L'intérêt de se focaliser sur ces VEs comme biomarqueurs est qu'elles sont diffusées vers la circulation générale et sont donc accessibles, en théorie, par l'intermédiaire d'une simple prise de sang. La stratégie envisagée dans ce projet est la mise en œuvre combinée des différentes méthodes de fractionnement par couplage flux force (FFF) que nous maitrisons pour l'isolement spécifique de VEs sécrétés par les CSCs permettant ensuite l'amélioration de la caractérisation des biomarqueurs dont ils sont porteurs. Les sous-populations exosomales purifiées puis caractérisés par notre stratégie analytique, autant unique qu'innovante, permettront d'identifier des biomarqueurs représentatifs du GB. Cette identification est le préalable indispensable à un diagnostic, un pronostic et un suivi thérapeutique potentiellement beaucoup plus performants. ExoFFF a pour objectif de développer une méthodologie permettant d'identifier des biomarqueurs spécifiques d'agressivité en oncologie. Cette méthodologie est multidimensionnelle, originale et basée sur les techniques de FFF, savoir-faire unique à l'échelle de la Nouvelle-Aquitaine et au niveau international. Une étude pré-clinique sera mise en place afin de rechercher de façon discriminante ces biomarqueurs dans le sang de patients et permettra de définir leur champ d'application en oncologie.

Glioblastoma (GB) is a high-grade tumor for which there is currently no curative treatment. Their therapeutic management remains complex, since these tumors always end up escaping, in short or long term, from the first lines of treatment. Tumor cells, and in particular cancer stem cells (CSCs), are partly responsible for these escapes and recurrences. These cells secrete highly aggressive extra-cellular vesicles (EVs), including exosomes, which ensure tumor dissemination and increase the therapeutic resistance of GB. The advantage of focusing on these EVs as biomarkers is that they are disseminated to the general circulation and are therefore accessible, in theory, via a simple blood test. The strategy envisaged in this project is the combined implementation of the various flow-force fractionation (FFF) methods we have mastered for the specific isolation of EVs from CSCs, enabling us to improve the characterization of the biomarkers they carry. In fact, these separation methods have both high separation power and the ability to preserve analytes such as cells and VEs. Exosomal subpopulations purified and characterized by our unique and innovative analytical strategy will enable us to identify biomarkers representative of GB. Such identification is a prerequisite for potentially much more effective diagnosis, prognosis and therapeutic follow-up. ExoFFF aims to develop a methodology for identifying specific biomarkers of aggressiveness in oncology. This methodology is multidimensional, original and based on FFF techniques, a unique know-how in the Nouvelle-Aquitaine region and internationally. A pre-clinical study will be set up to search for these biomarkers in the blood of patients in a discriminating manner, and to define their field of application in oncology.