Physique des nanocondensats transcriptionnels dans le sarcome d'Ewing

Physics of transcriptional nanocondensates in Ewing sarcoma

• Auteur / Autrice : Adèle Chassat
• Direction : Mathieu Coppey, Olivier Delattre
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Physique
• Date : Inscription en doctorat le 02/09/2024
• Etablissement(s) : Université Paris sciences et lettres
• Ecole(s) doctorale(s) : Physique en Ile de France
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire Physico-Chimie Curie
• Partenaire(s) de recherche : établissement opérateur d'inscription : Institut Curie - PSL

Mots clés

Mots clés libres

Ewing

Nanocondensats

Mouillage

Ewing

Nanocondensates

Wetting

Résumé

Le but de cette thèse est de comprendre le mécanisme physique derrière un cancer causé par une unique protéine de fusion. Nous pensons que la protéine à l'origine de cette maladie se lie collectivement à des sites aberrants dans le génome par un effet de ''mouillage'', au cours duquel des nano-gouttes de protéines se forment sur des séquences spécifiques d'ADN, dérégulant ainsi l'expression de gènes. Nous combinons analyse de données génomiques, modélisation et imagerie quantitative pour tester cette hypothèse.

In this PhD project, we propose to address the physical mechanisms behind a cancer due to a single protein fusion. Our idea is that the protein at the origin of the disease binds collectively at aberrant places on the genome through a “wetting” phenomenon, where nano-droplets of proteins accumulate on specific DNA sequences and lead to mis-regulation of gene expression. We will combine genomic data, physical modeling, and quantitative imaging to test our hypothesis.