Identification de gènes impliquées dans la régulation de la lyse tumorale médiée par les cellules NK par un crible pangénomique avec la technologie CRISPR-CAS9

Identification of genes involved in the regulation of NK cell-mediated tumor lysis by genome-wide CRISPR/Cas9 screen

• Auteur / Autrice : Hakim Medjouel khlifi
• Direction : Emilie Narni-mancinelli
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie-Santé - Spécialité Immunologie
• Date : Soutenance en 2024
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : CIML - Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : CIML - Les cellules lymphoïdes innées et la régulation neuronale de l'immunité
• Jury : Président / Présidente : Phillipe Naquet
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Emilie Narni-mancinelli, Carmelo Luci, Nathalie Bendriss vermare, Fabienne Anjuere, Leopold Kurz
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Carmelo Luci, Nathalie Bendriss vermare

Mots clés

Mots clés libres

Ligand

Cellules NK

Cancer

Ligand

NK cells

Cancer

Résumé

Les cellules Natural Killer (NK), qui font partie des cellules lymphoïdes innées (ILC), possèdent des capacités effectrices qui jouent un rôle crucial dans la lutte contre les tumeurs et les agents pathogènes. Elles sont capables de distinguer les cellules saines de celles qui sont tumorales ou infectées grâce à une gamme de récepteurs de surface, à la fois inhibiteurs et activateurs. L'activation de ces récepteurs déclenche des signaux qui orchestrent les fonctions effectrices des cellules NK. Ces cellules sont prodigieuses dans la production d'interféron gamma (IFN-γ) et sont uniques parmi les cellules de l'immunité innée en ce qu'elles peuvent induire la cytotoxicité médiée par les cellules. Mon projet de thèse s'est attaché à identifier un ligand tumoral spécifique pour NKp44, ainsi qu'à découvrir de nouveaux gènes jouant un rôle dans la régulation de la lyse des cellules tumorales par les cellules NK, utilisant pour cela un crible pangénomique basé sur la technologie CRISPR/Cas9. Ce crible visait à déterminer la résistance à la lyse des cellules tumorales cibles mutées par les cellules NK. Nous avons mené ce crible pangénomique pour créer une banque de données et avons ensuite méthodiquement classés et analysés les différents gènes candidats dans le but de répondre aux objectifs spécifiques de mon projet de thèse.

Natural killer (NK) cells, which belong to the innate lymphoid cell (ILC) family, have effector capabilities that play a crucial role in fighting tumors and pathogens. They can differentiate between healthy and tumor- or infection-infected cells through a series of surface receptors that have both inhibitory and activating effects. Activation of these receptors triggers signals that orchestrate the effector functions of NK cells. These cells produce high levels of interferon-gamma (IFN-γ) and are unique among innate immune cells in their ability to induce cell-mediated cytotoxicity. My thesis project focused on the identification of a specific tumor ligand for NKp44 and the discovery of novel genes involved in the regulation of tumor cell lysis by NK cells using a genome-wide screen based on CRISPR/Cas9 technology. This screening aimed to determine the resistance to lysis of target tumor cells mutated by NK cells. We performed this genome-wide CRISPR/Cas9 screen to create a database. We then systematically classified and analyzed the different candidate genes to achieve the specific goals of my dissertation project.