Thèse en cours

Effet du prétraitement biologique des déchets lignocellulosiques sur le rendement en bioH2 et la production d'AGV par fermentation obscure

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Auteur / Autrice : Roberto Campos
Direction : Nicolas BernetArquímedes Cruz López
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : APAB-Biotechnologie, Microbiologie
Date : Inscription en doctorat le 24/07/2023
Etablissement(s) : Montpellier, SupAgro en cotutelle avec Universidad Autónoma de Nuevo León
Ecole(s) doctorale(s) : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : LBE - Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement

Résumé

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TÍTULO : EFFET DU PRÉTRAITEMENT BIOLOGIQUE DES DÉCHETS LIGNOCELLULOSIQUES SUR LE RENDEMENT EN BIOH2 ET LA PRODUCTION DE VFAs PAR FERMENTATION ANAÉROBIE INTRODUCTION La consommation de combustibles fossiles tels que le charbon et les sous-produits du pétrole a eu des impacts environnementaux négatifs au cours des dernières décennies, car ces combustibles sont considérés comme les principaux polluants atmosphériques en raison des émissions de gaz à effet de serre telles que le dioxyde de carbone (CO2) lors de la combustion. Les combustibles fossiles proviennent de sources finies et leur consommation augmente, représentant 86 % de la demande mondiale d'énergie, le pétrole, le gaz et le charbon représentant respectivement 36 %, 27 % et 23 %, tandis que les sources renouvelables ne représentent que 14 % du total (Abas et al., 2015). En 2018, les émissions liées à la production d'énergie ont atteint un maximum historique de 407 ppm de CO2, dont 44 % provenaient de la combustion du charbon, 33 % du pétrole et 23 % du gaz naturel (REPSOL, 2019). Cependant, en 2021, ce record a été dépassé, atteignant 417 ppm de CO2 dans l'atmosphère (Tiseo, 2022). Au cours des dernières décennies, la recherche liée aux nouvelles énergies propres a augmenté. L'hydrogène (H2) a suscité un intérêt particulier ces dernières années dans le domaine des biocarburants en raison de ses caractéristiques qui confèrent une grande capacité énergétique et une combustion propre, sans émissions de CO2 (Singh et al., 2015). Ce vecteur énergétique peut être produit par différents méthodes thermochimiques, électrochimiques et biologiques (Cieciura-Włoch & Borowski, 2019). Parmi les différentes méthodes biologiques largement utilisées pour produire de l'H2 (bioH2), la fermentation sombre (DF) se distingue comme l'une des méthodes les plus prometteuses pour la production de bioH2 en raison de sa simplicité et de ses caractéristiques de mise à l'échelle facile (Chen et al., 2021). Pendant la DF, la dégradation de la matière organique en bioH2, CO2 et acides gras volatils (VFAs) se produit avec l'aide de différents micro-organismes anaérobies. Cette méthode présente plusieurs avantages, notamment l'utilisation d'une grande variété de déchets en tant que sources de carbone, tels que les déchets agricoles, les eaux usées et les déchets municipaux. Ainsi, la DF contribue au traitement et à la gestion des déchets (Bernardo Ruggeri, Tonia Tommasi, 2015 ; Ghimire et al., 2015 ; Noguer et al., 2022). D'autre part, la DF présente certaines limitations. Par exemple, la complexité des substrats utilisés dans la DF inhibe parfois la production de bioH2. Bien que la DF permette l'utilisation de certains déchets riches en glucides, ces déchets contiennent des polysaccharides complexes (par exemple, lignocellulose et amidon), qui sont difficilement dégradés par les micro-organismes habituellement utilisés en DF (Mattila et al., 2017). Plusieurs études ont utilisé des substrats complexes comprenant des fractions organiques de déchets municipaux, des biomasses riches en lignocellulose (paille de riz ou de blé, et tiges de maïs), du lactosérum et des eaux usées de l'industrie alimentaire (Show et al., 2021). On a constaté que certaines caractéristiques des substrats ont un impact direct sur la production de bioH2. À mesure que la complexité du substrat augmente, la production de bioH2 diminue. Guo et al., (2014) et Monlau et al., (2021) ont rapporté que les sucres réducteurs (sucres simples) contenus dans les substrats représentent la principale fraction de biomasse qui peut être convertie en bioH2. Par conséquent, des résultats positifs ont été obtenus lors de la production de bioH2 par DF, car les concentrations de sucres réducteurs augmentent après le prétraitement du substrat. Pour décomposer les polysaccharides en sucres réducteurs et augmenter la production de biogaz/bioH2, plusieurs méthodes physiques, chimiques et biologiques ont été mises en œuvre comme prétraitement (Ghimire et al., 2015 ; Hendriks & Zeeman, 2009 ; Mussoline et al., 2013 ; Zheng et al., 2014). Les prétraitements physiques sont généralement basés sur le broyage ou la trituration du substrat, les rayons gamma ou l'irradiation par micro-ondes, ainsi que le processus hydrothermal. D'autre part, les prétraitements chimiques consistent généralement en une hydrolyse acide ou alcaline et une ozonolyse (Taherzadeh & Karimi, 2008). Bien que les prétraitements physiques et chimiques soient attractifs pour les applications industrielles en raison de leur efficacité et de leur rapidité, ces méthodes présentent plusieurs inconvénients, par exemple, certaines d'entre elles nécessitent d'énormes quantités d'énergie et génèrent des composés toxiques (Ghimire et al., 2015). Le prétraitement biologique surmonte ces inconvénients dans la dégradation des polysaccharides. Des substrats complexes tels que les déchets lignocellulosiques peuvent être prétraités à l'aide de certaines espèces de champignons et d'actinomycètes qui délignifient et dégradent partiellement les fractions de cellulose de la lignocellulose à travers certaines enzymes (par exemple, l'hémicellulase et la cellulase), favorisant ainsi la formation de sucres réducteurs (Ghimire et al., 2015). Par exemple, la sciure exposée au champignon Pleurotus ostreatus a entraîné une augmentation de 48,0 µmol mL-1 de sucre par rapport au substrat non traité qui ne contenait que 2,5 µmol mL-1. De plus, la saccharification de la paille de riz a montré une augmentation de 75,3 % de la teneur en sucre après un prétraitement avec le champignon Pleurotus florida (Castoldi et al., 2014 ; Mackul´ak et al., 2012 ; Nayan et al., 2017). Les enzymes lignocellulolytiques extraites des champignons (par exemple, xylanases, cellulases et laccases) sont fondamentales dans un large éventail de processus biotechnologiques, y compris la production de biocarburants, et la bioremédiation des sols et de l'eau. De plus, l'industrie pharmaceutique tire parti de ces enzymes pour l'extraction de différents composés (Carrillo-Nieves et al., 2022, Khambhaty et al., 2018). Pendant le prétraitement biologique des substrats lignocellulosiques, certaines espèces de champignons sont utilisées pour la dégradation de la lignine et de l'hémicellulose. Les champignons de pourriture brune (BRF) attaquent la fraction de cellulose, tandis que les champignons de pourriture blanche (WRF) dégradent la fraction de cellulose et de lignine de la lignocellulose à travers des enzymes hydrolytiques. Ainsi, les WRF sont les basidiomycètes les plus efficaces dans la dégradation de la lignocellulose (Bhurat et al., 2020). Le prétraitement biologique des substrats lignocellulosiques surmonte les inconvénients présents dans les prétraitements physiques et chimiques, tels que la consommation élevée d'énergie et la génération de composés toxiques (par exemple, les furfurals et la concentration élevée de VFAs qui affectent la production subséquente de bioH2) (Kudanga & Le Roes-Hill, 2014). Selon cela, les WRF peuvent être utilisés pour augmenter l'efficacité de la DF pour la production de bioH2 en utilisant des substrats riches en lignocellulose, contribuant à la transition énergétique vers des énergies renouvelables et propres. À notre connaissance, seules quelques recherches ont exploré la dégradation des déchets lignocellulosiques par prétraitement biologique utilisant des WRF et leur utilisation ultérieure dans la production de bioH2. Par conséquent, le présent travail vise à étudier une co-digestion de déchets lignocellulosiques composés de pelures de fruits (FRP) et de drêches de brasserie (BSG) en tant que substrat par prétraitement biologique à l'aide des WRF Trametes versicolor et Pleurotus ostreatus par le biais d'un processus de fermentation en état solide pour favoriser la délignification et la saccharification de la lignocellulose afin d'augmenter la concentration de sucres réducteurs et de l'utiliser comme influent dans des bioréacteurs pour la production de bioH2 et de VFAs par DF. Certaines variables telles que le temps de prétraitement, la température et la souche fongique seront étudiées dans la phase de prétraitement, tandis que dans la DF, l'effet du prétraitement sur la production de bioH2, les communautés microbiennes et les voies métaboliques seront évalués. HYPOTHÈSES Le prétraitement biologique des déchets lignocellulosiques à l'aide de champignons de pourriture blanche améliorera la production de biogaz et de bioH2 par le biais du processus de fermentation sombre (DF). OBJECTIFS Objectif général Promouvoir la fermentation des sucres réducteurs par un prétraitement biologique à l'aide de champignons de pourriture blanche sur les substrats lignocellulosiques pour augmenter l'efficacité de la production de bioH2 par DF. Objectifs spécifiques 1. Utiliser les champignons de pourriture blanche (T. versicolor et P. ostreatus) pour le prétraitement biologique des déchets lignocellulosiques tels que les pelures de fruits (FRP) et les drêches de brasserie (BSG) afin de favoriser la génération de sucres réducteurs. 2. Déterminer les caractéristiques physico-chimiques de la co-digestion FRP-BSG (rapport C/N, pH, TCH, TN et RS). 3. Soumettre la co-digestion FRP-BSG à un prétraitement biologique utilisant T. versicolor et P. ostreatus pour la dégradation partielle de la lignocellulose, en ajustant des variables telles que la température et le temps de traitement par l'application d'un plan d'expériences factorielles mixtes 3x3x2. 4. Comparer la production de bioH2 en DF en alimentant le système avec la co-digestion prétraitée et la co-digestion non traitée (témoin) et évaluer le potentiel de production de bioH2 (BHP) en utilisant un consortium microbien comme inoculum issu de boues anaérobies granulaires obtenues à partir d'une station d'épuration des eaux usées. 5. Analyser les paramètres physico-chimiques en DF (pH, DCO, TCH, RS, TS, MS) et évaluer la production de bioH2 et de VFAs. 6. Sélectionner et enrichir un consortium microbien efficace et exploiter la DF dans un bioréacteur discontinu et continu. POTENTIEL INNOVANT Comme mentionné précédemment, les déchets organiques générés dans plusieurs activités économiques, agricoles et industrielles ne sont guère utilisés par les micro-organismes pour produire de l'énergie dans le processus de fermentation obscure en raison de leur complexité. En réponse à ce besoin, cette étude propose une méthodologie de prétraitement pour de tels déchets en utilisant deux champignons de pourriture blanche : T. versicolor et P. ostreatus, largement reconnus dans la littérature pour leur capacité à déligner et à saccharifier les résidus lignocellulosiques. Ce travail contribuera, en plus de la production d'énergie propre, à la gestion et à la valorisation des déchets tels que les épluchures de fruits (FRP) et les drèches de brasserie (BSG), qui sont largement générés quotidiennement. On estime que près de 50 % des déchets solides municipaux sont constitués de déchets organiques (déchets alimentaires, épluchures de fruits et légumes, etc.). De plus, les drèches de brasserie représentent la principale source de déchets générés dans le processus de brassage de la bière, représentant plus de 80 % du total des déchets générés au cours du processus. Le potentiel innovant de ce projet réside dans la méthodologie utilisée, car très peu d'études existent où des bioprocédés tels que la fermentation en état solide pour l'hydrolyse de la lignocellulose utilisant des champignons de pourriture blanche et la fermentation obscure pour la production de bioH2 sont couplés. IMPACT ET AVANTAGES DU PROJET Le projet actuel contribuera à comprendre l'impact du traitement biologique utilisant des champignons de pourriture blanche sur la production de biogaz et de bioH2 par le biais du processus de fermentation obscure. Ce faisant, il explore des techniques novatrices respectueuses de l'environnement pour traiter des substrats complexes, évitant la génération de résidus chimiques et la consommation d'énergie associée aux prétraitements chimiques et physiques. De plus, ce travail contribuera à la transition énergétique en cours des combustibles fossiles vers de nouvelles énergies propres et renouvelables, utilisant les déchets organiques pour la production d'énergie propre et ayant ainsi un impact positif sur l'environnement. Enfin, il contribuera également au développement des ressources humaines qui participeront à la diffusion des connaissances sur la génération d'énergies propres, favorisant le développement durable, ainsi que la diffusion scientifique des processus étudiés et des résultats obtenus. RÉFÉRENCES Abas, N., et al., (2015). Futures, 69, 31–49. https://doi.org/10.1016/j.futures.2015.03.003 Bernardo Ruggeri, Tonia Tommasi, S. S. (2015). BioH2 & BioCH4 Through Anaerobic Digestion. Springer. https://doi.org/10.1007/978-1-4471-6431-9 Bhurat, K. S., et al., (2020). Waste Disposal and Sustainable Energy. https://doi.org/10.1007/s42768-020-00054-9 Carrillo-Nieves, et al., (2022). Biomass Conversion and Biorefinery, 12(2), 253–264. https://doi.org/10.1007/s13399-020-00738-6 Castoldi, R., et al., (2014). Chemical Engineering Journal. https://doi.org/10.1016/j.cej.2014.07.090 Chen, Y., et al., (2021). International Journal of Hydrogen Energy. https://doi.org/10.1016/j.ijhydene.2020.11.096 Cieciura-Włoch, W., & Borowski, S. (2019). Journal of Environmental Engineering and Landscape Management, 27(2), 101–113. https://doi.org/10.3846/jeelm.2019.9806 Ghimire, A., et al., (2015). Applied Energy, 144, 73–95. https://doi.org/10.1016/j.apenergy.2015.01.045 Guo, X. M., et al., (2014). International Journal of Hydrogen Energy. https://doi.org/10.1016/j.ijhydene.2013.08.079 Hendriks, A. T. W. M., & Zeeman, G. (2009). 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