Thèse en cours

Surveillance et recherche opérationnelle One Health sur les maladies infectieuses émergentes en Afrique de l'ouest : l'exemple du réseau 4S au Sénégal

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Auteur / Autrice : Mamadou Barry
Direction : Denis MalvyMathias Altmann
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Santé publique Option Epidémiologie
Date : Inscription en doctorat le 06/11/2023
Etablissement(s) : Bordeaux
Ecole(s) doctorale(s) : Sociétés, Politique, Santé Publique
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Bordeaux Population Health Research Center
Equipe de recherche : E2 - Global Health in the global South_GHiGS

Résumé

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Les maladies infectieuses émergentes (MIE) représentent une préoccupation majeure de santé publique à l'échelle mondiale, particulièrement en Afrique, où leur impact sur les populations vulnérables est considérable. Les outils de surveillance mis en place pour leur détection précoce et une réponse efficace sont souvent inadéquats. La récente pandémie de COVID-19 a mis en lumière les faiblesses des systèmes de santé africains en matière de surveillance et de riposte. Les changements climatiques et environnementaux, l'action anthropique, ainsi que les mouvements des animaux et des vecteurs entraînent des bouleversements écosystémiques constituant de véritables menaces pour l'émergence de maladies zoonotiques dans le futur. Par exemple, la propagation de certaines maladies infectieuses, comme celles transmises par le moustique tigre ou la tique, s'accélère déjà à travers le monde, y compris au Sénégal, notamment dans la région de Matam, située au nord du pays et considérée comme une zone d'endémie pour les virus de la Fièvre Hémorragique Crimée-Congo (FHCC). Face à cette situation, les systèmes de surveillance continuent, pour la plupart, d'opérer en silo, avec des dispositifs sectoriels très peu interconnectés. De plus, les données sur l'utilité de la surveillance selon l'approche One Health et sur l'opérationnalisation de ce concept restent très limitées. Le virus de la FHCC est une des maladies émergentes touchant à la fois les humains, les animaux domestiques et sauvages, et qui est devenue endémique en Afrique de l'Ouest. Une recrudescence des cas a été observée ces dernières années, probablement liée à la dissémination accrue des tiques, favorisée par les changements climatiques. Cependant, peu de données sont disponibles à ce jour pour étudier les déterminants de l'émergence de la maladie, la dynamique de transmission entre les humains, les vecteurs et les animaux, ainsi que l'impact des changements climatiques sur cette dynamique, afin d'orienter efficacement les stratégies de lutte. Grâce à une collaboration entre le Ministère de la Santé et l'Institut Pasteur de Dakar (IPD), un réseau de surveillance sentinelle syndromique, appelé « réseau 4S », a été mis en place au Sénégal depuis 2012, dans le but de détecter précocement et d'investiguer les MIE. Plusieurs projets de recherche opérationnelle sur les MIE ont été menés dans les sites sentinelles du réseau 4S, incluant des approches intégrées One Health, au cours des cinq dernières années. Dans cette thèse, nous analyserons des données collectées dans le cadre de cette collaboration sur les sites du réseau 4S. Il s'agit d'une thèse par publications, dans laquelle trois études seront présentées. La première étude exploitera les données de surveillance humaine provenant de l'ensemble des sites sentinelles du réseau 4S entre 2015 et 2023. Nous décrirons les défis et les étapes nécessaires au développement d'un système de surveillance sentinelle au Sénégal, et évaluerons les informations qu'il fournit en temps réel pour améliorer la prise de décision en santé publique. La deuxième étude visera à caractériser et évaluer la plus-value d'un système de surveillance One Health dans l'écosystème de Matam. Enfin, la troisième étude portera sur la dynamique de transmission du virus de la dengue au Sénégal, en s'appuyant sur des données d'investigation de terrain collectées lors de flambées épidémiques et sur les données de surveillance issues des sites sentinelles du réseau 4S. Cette thèse apportera trois contributions principales : 1. La description d'un système innovant de surveillance et son impact sur la prise de décision en matière de santé publique. 2. Une exploration de l'approche One Health pour renforcer la surveillance et anticiper l'émergence d'épidémies de FHCC. 3. Une meilleure compréhension de la dynamique de transmission de la dengue au Sénégal, grâce à des investigations de terrain basées sur les données de surveillance humaine, vectorielle et environnementale.