Thèse en cours

Développement d'outils bioinformatique pour la caractérisation et l'analyse de génomes viraux

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Auteur / Autrice : Vincent Wilde
Direction : François-Patrice Ferron
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie-Santé - Spécialité Bioinformatique et Génomique
Date : Inscription en doctorat le 01/10/2021
Etablissement(s) : Aix-Marseille
Ecole(s) doctorale(s) : Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : AFMB - Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques
Equipe de recherche : AFMB - Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design

Résumé

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De large quantité de données génomiques virales sortent des séquenceurs chaque année. Cette avalanche de données ne mène pas à la production de connaissances scientifiques immédiates. Ce paradoxe vient de ne pas avoir anticipé les outils d'analyse et de transfert de savoir à l'interface des domaines de la biologie i.e métagénomique virale, bio-informatique, protéomique fonctionnelle et structurale. Fort de ce constat nous proposons le projet BIOCHAVIR qui vise au développement d'outils à destination de la communauté scientifique afin de lui donner un accès rapide cohérent et compréhensible aux données virales. Le projet présente un aspect pluridisciplinaire qui va de la programmation à la capacité d'analyse et mise en perspective des données biologiques. Le laboratoire d'accueil présente tous les aspects (génomique, bio-informatique, protéomique, biologie structurale des virus) et expertises pour développer ses outils et donner sens aux problématiques de l'utilisateur final.