Cartographie des microorganismes vectorisés par des tiques à intérêt médical et vétérinaire en République de Guinée

Mapping of tick-borne microorganisms of medical and veterinary interest in the Republic of Guinea

• Auteur / Autrice : Karifa Camara
• Direction : Florence Fenollar
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie-Santé - Spécialité Maladies Infectieuses
• Date : Inscription en doctorat le 01/09/2023
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la vie et de la santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : RITMES - Risques Infectieux Tropicaux, Microorganismes EmergentS

Mots clés

Mots clés libres

Cartographie

Tiques

Microrganismes

Médical

Vétérinaire

Guinée

Mapping

Ticks

Tick-borne microorganisms

Medical

Veterinary

Republic of Guinea

Résumé

En Guinée, les animaux domestiques sont majoritairement élevés dans un système extensif ; ce qui les expose à des tiques et aux microorganismes transmis par des tiques. Certains de ces microorganismes vectorisés par les tiques sont zoonotiques. L'objectif de cette thèse est de faire une cartographie des microorganismes transmis par des tiques à intérêt médical et vétérinaire en République de Guinée. Il s'agira d'une étude transversale descriptive. Un total de 7000 tiques soit 800 par région seront collectées sur les bovins, ovins, caprins, porcins et chiens. L'identification morphologique, la culture cellulaire, la spectrométrie de masse (MALDI-TOF) la polymérase en chaîne réaction,le génotypage, le séquençage de nouvelle génération et le séquençage de Sanger seront réalisés sur l'ensemble des échantillons.

In Guinea, domestic animals are mainly reared in an extensive system, which exposes them to ticks and tick-borne micro-organisms. Some of these tick-borne microorganisms are zoonotic. The aim of this thesis is to map tick-borne microorganisms of medical and veterinary interest in the Republic of Guinea. This will be a descriptive cross-sectional study. A total of 7000 ticks, i.e. 800 per region, will be collected from cattle, sheep, goats, pigs and dogs. Morphological identification, cell culture, mass spectrometry (MALDI-TOF), polymerase chain reaction, genotyping, next-generation sequencing and Sanger sequencing will be carried out on all the samples.