Qu'est-ce qu'une plante individuelle ? Approche comparative des notions d'individualité et d'identité chez les Embryophytes et les Eumétazoaires.

What is an individual plant? A comparative approach of the notion of individuality and identity in Embryophytes and Eumetazoa.

• Auteur / Autrice : Shaan Lepaul-picolet
• Direction : Sophie Gerber, Etienne Roux
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Épistémologie et histoire des sciences
• Date : Inscription en doctorat le 26/09/2023
• Etablissement(s) : Bordeaux
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences et Environnements (Talence, Gironde ; 1999-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : BIOGECO - BIOdiversité, Gènes & Communautés
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : EcoGeRe - ECOlogie et GEnétique de la conservation et de la REstauration

Mots clés

Mots clés libres

Biologie animale

Épistémologie

Biologie végétale

Animal biology

Plant biology

Epistemology

Résumé

La question de l'individu ou de l'organisme individuel est une notion fondamentale en biologie, sans laquelle les concepts de fonction physiologique, de lignée reproductive, d'adaptation, d'évolution, de population, voire même d'écosystème, ne peuvent être étudiés ni même formulés. Or, si la notion d'individu semble intuitivement simple et suffisamment évidente pour que les biologistes se dispensent, dans la plupart des cas, d'en donner une définition, les propriétés fondamentales qui permettent de définir ce qu'on entend par « individu » biologique, et les critères d'individuation qui permettent d'attribuer à une entité ce statut « d'individu », ne sont pas épistémologiquement clairs et la littérature philosophique contemporaine n'a pas abouti à un consensus sur ces questions [1], en particulier chez les plantes. La difficulté des approches philosophiques à définir de manière consensuelle en quoi consiste l'individualité végétale génère une situation de flou épistémique autour du concept de « plante individuelle », pourtant d'usage fréquent et « spontané » dans la recherche actuelle en biologie des plantes terrestres (appelées Embryophytes), que ce soit dans des domaines de recherche en écologie, en démographie, en physiologie ou en biologie de l'évolution, avec des implications sociales importantes concernant la manière d'envisager les plantes et les modes de politique de gestion, de protection et de conservation. Fondamentalement, les Embryophytes ont un développement et une organisation modulaire, basée sur la répétition d'une unité de base de l'architecture – le module – continuellement réexprimée [2]. Ce mode de croissance indéterminée leur permet d'exprimer une grande diversité de formes, accordées aux contraintes environnementales [3]. Historiquement et actuellement, les arbres et les plantes individuelles sont régulièrement décrits par des botanistes, philosophes, naturalistes ou biologistes comme des colonies, des rassemblements de bourgeons, des êtres multiples et composites [4], plutôt que comme des individus unifiés. Les Embryophytes sont en effet capables d'embryogenèse somatique, susceptibles de constituer de larges populations clonales, et de ce fait supposés être caractérisés par un mosaïcisme génétique, dont l'importance reste à démontrer [5]. Les Embryophytes se définiraient alors comme des entités modulaires, polygénomiques et polyembryoniques, avec comme conséquence que les différents critères d'identité et d'individualité ne convergeraient pas nécessairement au même niveau, l'unité génétique (genet) différant par exemple de l'unité morphofonctionnelle (ramet) [3,6,7].

The question of the individual or of the individual organism is a fundamental notion in biology, without which the concepts of physiological function, reproductive lineage, adaptation, evolution, population, and even ecosystem, cannot be studied or even formulated. However, if the notion of individual seems intuitively simple and sufficiently obvious for biologists to dispense, in most cases, with a definition, the fundamental properties that make it possible to define what is meant by a biological 'individual', and the criteria of individuation that make it possible to attribute to an entity this status of 'individual', are not epistemologically clear, and the contemporary philosophical literature has not led to a consensus on these questions [1], in particular in plants. The philosophical approaches that would define in a consensual way what plant individuality consists of are difficult to achieve and generate a situation of epistemic vagueness around the concept of 'individual plant'. However, the term 'individual plant' is of frequent and 'spontaneous' use in current research in terrestrial plant (Embryophytes) biology, in fields of research such as ecology, demography, physiology, or evolutionary biology, with important social implications related to the ways plants are considered, in the frame of management, protection, and conservation policies. Fundamentally, Embryophytes have a modular development and organization, based on the repetition of a basic unit of architecture - the module - that is continuously re-expressed [2]. This mode of indeterminate growth allows them to express a great diversity of forms, tuned to environmental constraints [3]. Historically and currently, trees and individual plants are regularly described by botanists, philosophers, naturalists or biologists as colonies, group of buds, multiple and composite beings [4], rather than as unified individuals. Embryophytes are indeed capable of somatic embryogenesis, are likely to constitute large clonal populations, and thus are supposed to be characterized by genetic mosaicism, whose importance remains to be demonstrated [5]. Embryophytes would then be defined as modular, polygenomic and polyembryonic entities, the different criteria of identity and individuality would therefore not necessarily converge at the same level, the genetic unit (genet) differing for example from the morphofunctional unit (ramet) [3,6,7].