Altération des P-Bodies au cours du vieillissement de l'ovocyte

Alteration of P-Body during oocyte aging

• Auteur / Autrice : Chloe Leray
• Direction : Arnaud Hubstenberger
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Interactions Moléculaires et Cellulaires
• Date : Inscription en doctorat le 01/10/2023
• Etablissement(s) : Université Côte d'Azur
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences de la vie et de la santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : INSTITUT DE BIOLOGIE VALROSE
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Epitranscriptomics

Mots clés

Mots clés libres

Vieillissement

P-Bodies

Régulation post-transcriptionnelle

C. elegans

Aging

P-Body

Post-transcriptional regulation

C. elegans

Résumé

Dans l'ovocyte, les ARNm maternels qui encodent le programme embryonnaire précoce sont réprimés, agrégés et stockés dans des granules ARN appelés ProcessingBodies (P-Bodies). L'organisme modèle C. elegansa permis de montrer que l'intégrité de ces réservoirs d'ARNm maternels est essentielle pour que les ovocytes s'adaptent à une quiescence prolongée et maintiennent leur fertilité. En revanche, chez les animaux âgés, une altération de la morphologie des P-bodies suggère que les fonctionnalités des P-bodies peuvent dégénérer au cours du vieillissement. Ici, nous proposons d'étudier comment le vieillissement de l'ovocyte altère les fonctions des P-Bodies. Pour cela, je disséquerai l'altération du contrôle de la traduction des ARNm quiest associée aux changements de composition de P-Bodies, et je testerai la perte de l'effet tampon des P-Bodies lors du vieillissement de l'ovocyte de C. elegans.Précédemment l'équipe a montré que chez des ovocytes jeunes et fertilesqueles ARNm maternels réprimés étaient condensés et stockés dans les P-bodies. Pour disséquer les liens entre répression de la traduction et condensation des ARNm au cours du vieillissement, je combinerai deux approches «omiques».Le «polysome profiling» permettra demesurerla traduction des ARNm, tandis quela méthode de FAP-Seq identifierales ARNm condensés dans les P-bodies. Enfin, par des approches d'imagerie molécule unique, je quantifierai si la capacité des P-bodies à tamponner l'accumulation des ARNm réprimés est conservée au cours du vieillissement. Je testerai ainsi comment le rôle protecteur des P-bodies,comme réservoir de stockage des ARNm maternels réprimés,est maintenue ou altéré au cours du vieillissement.Pour adresser les problèmes d'infertilité, l'originalité de mon projet de recherche est de s'intéresser non pas aux altérations génomiquesmais transcriptomiquesau cours du vieillissement.

In the oocyte, maternal mRNAs encoding the early embryonic program are repressed, aggregated and stored in RNA granules called ProcessingBodies (P-Bodies). The model organism C. elegansa showed that the integrity of these maternal mRNA reservoirs is essential for oocytes to adapt to prolonged quiescence and maintain fertility. In contrast, in aged animals, altered P-body morphology suggests that P-body functionality may degenerate during aging. Here, we propose to study how oocyte aging alters P-body functions. To this end, I will dissect the altered control of mRNA translation that is associated with changes in P-body composition, and test the loss of the buffering effect of P-bodies during C. elegans oocyte aging.Previously the team showed that in young, fertile oocytesrepressed maternal mRNAs were condensed and stored in P-bodies. To dissect the links between translational repression and mRNA condensation during aging, I will combine two omics approaches: polysome profiling to measure mRNA translation, and FAP-Seq to identify condensed mRNAs in P-bodies. Finally, using single-molecule imaging approaches, I will quantify whether the ability of P-bodies to buffer the accumulation of repressed mRNAs is maintained during aging. In this way, I will test how the protective role of P-bodies, as a storage reservoir for repressed maternal mRNAs, is maintained or altered during aging. To address infertility issues, the originality of my research project is to focus not on genomic but on transcriptomic alterations during aging.