Amorçage de l'expression génique et plasticité phénotypique au cours des réponses d'Arabidopsis à la lumière
Auteur / Autrice : | Clarisse Zigue |
Direction : | Fredy Barneche |
Type : | Projet de thèse |
Discipline(s) : | Génétique |
Date : | Inscription en doctorat le 01/03/2023 |
Etablissement(s) : | université Paris-Saclay |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Sciences du Végétal : du gène à l'écosystème |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Institut de biologie de l'École normale supérieure (Paris ; 2010-....) |
Equipe de recherche : Génomique des Plantes et Diatomées | |
référent : Faculté des sciences d'Orsay |
Mots clés
Mots clés libres
Résumé
Des travaux antérieurs du laboratoire hôte ont révélé que l'induction de gènes sensibles à la lumière au cours de la photomorphogenèse des semis est renforcée par une exposition préalable à une exposition courte et transitoire (1 heure) à la lumière. L'existence, la pertinence physiologique, et les mécanismes moléculaires qui sous-tendent l'amorçage des plantes par la lumière restent inconnus. Ces processus pourraient significativement favoriser la vigueur des semis en agriculture, en particulier sous conditions de forte luminosité (vagues de chaleur, haute altitude, basse latitude). L'étudiante étudiera quelles voies de signalisation lumineuse et chromatinienne sont sensibilisées par une exposition initiale à la lumière pour amorcer les réponses adaptatives ultérieures. À l'aide d'approches épigénomiques et transcriptomiques, elle contrastera et comparera les modifications de l'épigénome (marques et accessibilité de la chromatine) et de l'expression génique induites par amorçage chez l'espèce modèle Arabidopsis thaliana, et évaluera l'existence de tels mécanismes chez une espèce cultivée. En parallèle, l'étudiante explorera les effets transgénérationnels possibles de l'acclimatation à la haute lumière dans des lignées d'Arabidopsis ayant des histoires de vie dans des environnements différents.