dynamique des protéines de réparation de l'adn au niveau des nucléosomes

Dynamics of DNA repair proteins at nucleosomes

• Auteur / Autrice : Safwen Ghediri
• Direction : Fabrizio Cleri, Ralf Blossey
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Electronique, microélectronique, nanoélectronique et micro-ondes
• Date : Inscription en doctorat le 01/03/2023
• Etablissement(s) : Université de Lille (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : ENGSYS Sciences de l'ingénierie et des systèmes
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut d'Electronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie

Mots clés

Mots clés libres

Dynamique moléculaire

Programmation

Analyse des donnés

Docking

Molecular dynamics

Coding

Docking

Data analysis

Résumé

Dans ce projet, nous proposons une étude informatique et expérimentale combinée des mécanismes de reconnaissance moléculaire par lesquels les protéines de réparation du processus de réparation par excision de bases identifient les premiers stades des dommages à l'adn de la fibre de chromatine. nous visons à comprendre comment les régions d'adn endommagées sont identifiées, l'effet du compactage des nucléosomes sur l'accès des protéines de réparation aux zones endommagées et le rôle de la dynamique intrinsèque des nucléosomes dans le processus de reconnaissance.

In this project we propose a combined computational and experimental study of the molecular recognition mechanisms by which repair proteins of the base-excision repair process identify early stages of dna damage of the chromatin fiber. we aim to understand how damaged dna regions are identified, the effect of the compaction of nucleosomes on the access of repair proteins to damaged areas and the role of intrinsic dynamics of nucleosomes in the recognition process.