Analyse génomique de pathologies psychiatriques et exploration des gènes et voies liés à l'immunité

Genomic analysis of psychiatric diseases and exploration of immune-related genes and pathways

• Auteur / Autrice : Maxime Tison
• Direction : Jean-François Zagury
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences pour l'ingénieur spécialité Bioinformatique
• Date : Inscription en doctorat le 14/11/2022
• Etablissement(s) : Paris, CNAM
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences des métiers de l'ingénieur
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : GBCM - Génomique, bioinformatique et chimie moléculaire

Mots clés

Mots clés libres

Gwas

Hla

Maladies psychiatriques

Cmh

Variants génétiques

Gwas

Hla

Psychiatric diseases

Mhc

Genetic variants

Résumé

L'équipe de recherche du laboratoire GBCM a été pionnière dans l'analyse à l'échelle du génome des données génomiques à haut-débit de cohortes associées à des maladies. Ce projet de thèse vise à exploiter les données génomiques de maladies psychiatriques, et notamment les conduites suicidaires. Des analyses sur ces cohortes de patients seront menées et cibleront aussi en particulier les gènes et voies liés à l'immunité, notamment sur la région du CMH (Complexe Majeur d'Histocompatibilité). En effet, de nombreux arguments sous-tendent que les maladies psychiatriques évoluent grâce à un terreau reposant sur des déséquilibres inflammatoires ou du système immunitaire. La découverte de nouvelles associations génétiques dans ces maladies devrait permettre de mieux comprendre les mécanismes moléculaires qui en sont la cause, et en conséquence, aider au développement rationnel de nouvelles stratégies diagnostiques ou thérapeutiques ciblant les protéines ou voies biologiques qui y sont impliquées.

The GBCM laboratory research team has pioneered the genome-wide analysis of high-throughput genomic data from disease-associated cohorts. The aim of this thesis project is to exploit genomic data on psychiatric diseases, in particular suicidal behavior. Analyses will be carried out on these patient cohorts, focusing in particular on immunity-related genes and pathways, notably in the MHC (Major Histocompatibility Complex) region. Indeed, there is strong evidence to suggest that psychiatric illnesses evolve on the basis of inflammatory or immune system imbalances. The discovery of new genetic associations in these illnesses should lead to a better understanding of the molecular mechanisms behind them, and consequently help in the rational development of new diagnostic or therapeutic strategies targeting the proteins or biological pathways involved.