Diversité et performance des bactéries endophytes et rhizosphériques pour la stimulation de la croissance de Synsepalum dulcificum (Schumach & Thonn.) Daniell

Diversity and performance of endophytic and rhizospheric bacteria for growth promotion of Synsepalum dulcificum (Schumach & Thonn.) Daniell

• Auteur / Autrice : Rabiath Adigoun
• Direction : Emile Benizri, Aime Bokonon-ganta, Alexis Durand
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences agronomiques
• Date : Inscription en doctorat le 09/03/2023
• Etablissement(s) : Université de Lorraine en cotutelle avec Université d'Abomey-Calavi (UAC)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale SIReNa - Science et ingénierie des ressources naturelles (Lorraine ; 2018-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : LSE - Laboratoire Sols et Environnement

Mots clés

Mots clés libres

Diversité variétale

Bactéries endophytes et rhizosphériques

Traits PGP (Plant Growth Promoting)

Séquençage haut débit

Microbiologie

Biologie moléculaire

Varietal diversity

Endophytic and rhizospheric bacteria

Traits PGP (Plant Growth Promoting)

High-throughput sequencing

Microbiology

Molecular biology

Résumé

Synsepalum dulcificum (Schumach & Thonn.) Daniell est un arbuste originaire de l'Afrique de l'Ouest qui est célèbre pour ses baies rouges, communément appelées en langue nationale béninoise Fon « Sisrè », connues pour être, à ce jour, la seule source naturelle de « miraculine », une glycoprotéine à propriété édulcorante contenue dans la pulpe du fruit. Cette espèce présente plusieurs avantages sur le plan alimentaire, nutritionnel, médicinal et économique. C'est une ressource bioéconomique stratégique dont la production importante permettrait d'accélérer le développement socio-économique des pays producteurs et exportateurs. Cependant sa culture est encore très peu développée et est soumise à plusieurs contraintes de production : le cycle de production long, les attaques des bioagresseurs, la durée courte de conservation des fruits. Pour faire face à ces contraintes, des solutions tels les biostimulants et les stimulateurs des défenses des plantes pourraient constituer un nouveau levier à l'amélioration du développement et de la production de S. dulcificum. Ainsi, dans ce contexte de protection agro-écologique des productions végétales, l'utilisation de bactéries d'intérêt dites PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) et/ou PGPE (Plant Growth Promoting Endophyte), favorisant d'une part, l'absorption des éléments nutritifs par les plantes et d'autre part, la croissance des plantes inoculées, apparait comme un levier novateur et durable. Ce projet vise dans un premier temps à étudier la diversité des communautés rhizosphériques et endophytes bactériennes d'un panel de génotypes/variétés « élites » de S. dulcificum. Dans un second temps le projet vise à isoler les bactéries d'intérêts en vue de créer un consortium pouvant stimuler le développement et la production de S. dulcificum.

Synsepalum dulcificum (Schumach & Thonn.) Daniell is a shrub native to West Africa famous for its red berries, commonly known in the Beninese national language Fon as 'Sisrè', known to be the only natural source of 'miraculin', a glycoprotein with sweetening properties contained in the fruit pulp. This species has several food, nutritional, medicinal and economic advantages. It is a strategic bio-economic resource whose significant production would accelerate the socio-economic development of producing and exporting countries. However, its cultivation is still underdeveloped and is subject to several production constraints: the long production cycle, attacks by pests, and the short shelf life of the fruit. To face these constraints, solutions such as biostimulants and plant defence stimulators could constitute a new lever to improve the development and production of S. dulcificum. Thus, in this context of agro-ecological protection of plant production, the use of bacteria of interest called PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) and/or PGPE (Plant Growth Promoting Endophyte), promoting, on the one hand, the absorption of nutrients by plants and on the other hand, the growth of inoculated plants, appears as an innovative and sustainable lever. This project aims firstly to study the diversity of rhizospheric and endophytic bacterial communities of a panel of 'elite' genotypes/varieties of S. dulcificum. In the second phase, the project aims to isolate the bacteria of interest in order to create a consortium that can stimulate the development and production of S. dulcificum.