Analyse de la fonction des granules ARN: exemple des granules germinaux chez la drosophile

Functional analysis of RNA granules: example of Drosophila germ granules

• Auteur / Autrice : Ali Haidar
• Direction : Martine Simonelig
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie Santé
• Date : Inscription en doctorat le 30/09/2021
• Etablissement(s) : Université de Montpellier (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé (Montpellier ; Ecole Doctorale ; 2015-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : IGH - Institut de Génétique Humaine
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Régulation des ARNm et développement

Mots clés

Mots clés libres

Contrôle traductionel

Imagerie en molecule unique

Séparation de phase

Génétique

Régulation des ARNm

Granule ARN

Genetics

Phase separation

Single molecule imaging

MRNA regulation

RNA granule

Translational regulation

Résumé

Un grand nombre de données récentes a mis en évidence l'importance du phénomène de séparation de phase dans la formation de condensats ou granules, essentiels à l'organisation des réactions biologiques dans la cellule. Certains de ces condensats s'assemblent à partir d'ARNs et de RNA binding proteins et forment des granules ARN qui sont impliqués dans la régulation d'ARNm. Les relations entre l'organisation structurelle et la fonction de ces granules sont peu connues. Le projet de thèse reposera sur l'analyse des granules germinaux de la drosophile dont les fonctions sont les mieux connues, pour comprendre les liens entre organisation et fonctions des granules ARN. Le projet mettra en oeuvre des approches novatrices d'imagerie de molecules uniques pour analyser la traduction en temps réel dans les granules germinaux, ainsi que des approches de purification de particules fluorescentes pour identifier le contenu en ARNs et protéines de ces granules ARN.

Many recent data have highlighted the importance of phase separation in the assembly of membraneless condensates or granules that play a key role in organizing biological reactions within the cell. Some of these membraneless condensates are RNA granules that assemble from RNAs and RNA binding proteins and are involved in mRNA regulation. The relationships between the organization of these RNA granules and their functions are poorly understood. The PhD project aims at analyzing germ granules in Drosophila, whose functions are better understood, to decipher the links between organization and functions of RNA granules. The project involves innovative single molecule imaging approaches to record ongoing translation in germ granules, as well as fluorescence-activated particle sorting to purify germ granules and identify their full protein and RNA content.