Étude de facteurs de restrictions s'opposant à la réplication du virus de l'Hépatite Delta et de la famille des Deltavirus

Study of restriction factors inhibiting the replication of Hepatitis D virus and the Deltavirus family

• Auteur / Autrice : Zoé Denis
• Direction : Karim Majzoub, Valérie Courgnaud
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie Santé
• Date : Inscription en doctorat le 23/01/2023
• Etablissement(s) : Université de Montpellier (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : IGMM - Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Virus à ARN et facteurs hôte

Mots clés

Mots clés libres

Virus de l'Hepatite D

Crible genetique

Deltavirus

Microscopie confocale

Genetic Screen

Deltavirus

Hepatitis D virus

Confocal Microscopy

Résumé

Le sujet de thèse porte sur l'étude de facteurs de restrictions qui s'opposent à la réplication du virus de l'Hépatite Delta et la famille des Deltavirus en général. Un crible génétique concentré sur la famille de gènes ISGs (Interferon Stimulated Genes) sera effectué pour identifier des gènes qui réguleraient négativement l'expression du génome viral. La contribution des candidats identifiés dans la réplication des Deltavirus sera ensuite étudiée par des méthodes de déplétion et de sur-expression génétique (cDNA, CRISPR), microscopie (smFISH, Immunofluorescence), Western Blot, qPCR et Northern blot. Ces techniques seront effectuées dans plusieurs lignées cellulaires animales (humain, rongeur, serpent) ainsi que dans un modèle animal souris. Le but du projet est d'identifier et caractériser les ISGs suspectés d'inhiber la réplication des Deltavirus. Ce sujet permettra d'apporter d'importantes connaissances fondamentales de l'immunité des animaux face à la famille des Deltavirus. En outre, ces connaissances pourraient déboucher sur de nouvelles stratégies antivirales appliquées, pour lutter contre cette famille de virus, contre laquelle il n'existe pas d'antiviraux efficaces.

The thesis topic focuses on the study of restrictive factors that oppose the replication of the Hepatitis Delta virus and the Deltavirus family in general. A genetic screen focused on the ISGs (Interferon Stimulated Genes) gene family will be performed to identify genes that would negatively regulate viral genome expression. The contribution of the identified candidates in Deltavirus replication will then be studied by gene depletion and overexpression methods (cDNA, CRISPR), microscopy (smFISH, Immunofluorescence), Western blot, qPCR and Northern blot. These techniques will be performed in several animal cell lines (human, rodent, snake) as well as in a mouse animal model. The aim of the project is to identify and characterize ISGs suspected of inhibiting Deltavirus replication. This topic will provide important fundamental knowledge of animal immunity to the Deltavirus family. Moreover, this knowledge could lead to new applied antiviral strategies to fight against this family of viruses, against which there are no effective antivirals.