Simulations multi-échelles non-adiabatiques des chevaux de Troyes photo-induits dans l'ADN

Unraveling DNA photo-induced Trojan Horses by multiscale molecular modeling and non-adiabatic dynamic simulations

• Auteur / Autrice : Marziogiuseppe Gentile
• Direction : Jean-Christophe Tremblay, Francesco Talotta
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Inscription en doctorat le 20/01/2023
• Etablissement(s) : Université de Lorraine en cotutelle avec University de Vienne
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale C2MP - Chimie mécanique matériaux physique (Lorraine ; 2018-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : LPCT - Laboratoire de Physique et Chimie Théoriques

Mots clés

Mots clés libres

Adn

Modeling moleculaire

Dinamiques non-adiabatiques

Dna

Molecular modeling

Non-adiabatic dynamics

Résumé

Le poste sera axé sur la simulation de la dynamique photoinduite dans l'ADN par l'excitation de chromophores sensibles à l'environnement, tels que la palmatine, ou de chevaux de Troie nucléobases. Le traitement multi-échelle de ces processus sera réalisé par des simulations dynamiques à saut d'état, où l'inclusion des effets environnementaux sera décrite à l'aide de la méthodologie hybride QM/MM mise en œuvre dans le code SHARC.

The position will focus on the simulation of photoinduced dynamics in DNA through excitation of environmental sensitive chromophores, such as palmatine, or Trojan horses nucleaobases. The multiscale treatment of such processes will be achieved through state-hopping dynamics simulations, where inclusion of environmental effects will be described using the hybrid-QM/MM methodology implemented in the SHARC code.