Diversité génétique et taxonomique des communautés à isoétides des lacs et étangs du littoral aquitain

Genetic and taxonomic diversity of isoetids communities in lakes of the French Aquitaines' shoreline

• Auteur / Autrice : Estelle-Marie Blanquart
• Direction : Aurélien Jamoneau, Olivier Lepais
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés
• Date : Inscription en doctorat le 25/11/2022
• Etablissement(s) : Bordeaux
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences et Environnements (Talence, Gironde ; 1999-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : EABX - Écosystèmes aquatiques et changements globaux
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : ECOVEA - Ecologie des COmmunautés VEgétales Aquatiques et impact des pressions multiples

Mots clés

Mots clés libres

Dispersion

Flux de gènes

Diversité multi-échelles

Relation diversité taxonomique-génétique

Conservation

Métapopulation

Dispersion

Gene flow

Multi-scale diversity

Taxonomic-genetic relationship

Conservation

Metapopulation

Résumé

Les lacs et étangs du littoral aquitain sont des écosystèmes uniques à l'échelle nationale mais également européenne. Ces milieux hébergent une diversité biologique importante et notamment d'un point de vue végétal. Les communautés à isoétides représentent ainsi un ensemble d'espèces d'intérêt patrimonial, abritant même une espèce endémique. Elles sont cependant aujourd'hui fortement menacées, notamment par les activités humaines, et la plupart des lacs du littoral aquitain accusent d'ores et déjà la disparition de ces espèces protégées. La connaissance sur ces populations est cependant limitée, voire nulle en ce qui concerne leur diversité génétique. Alors que des opérations de conservation et de restauration sont envisagées pour protéger ces espèces, il s'avère essentiel d'acquérir une base d'information sur la structure génétique des populations, leur lien avec la diversité taxonomique et le fonctionnement en métapopulation et métacommunauté de ces habitats reconnus d'intérêt communautaire. Ce projet de thèse s'articulera autour de 3 axes principaux. Dans un premier temps une analyse comparative de la répartition de la diversité génétique sera effectuée chez une dizaine d'espèces caractéristiques de ces communautés. Ensuite, le lien entre la diversité taxonomique et la diversité génétique sera étudié. Enfin, ces résultats seront placés dans une perspective de restauration et conservation, en analysant plus finement la connectivité à l'échelle régionale (entre les différents lacs) et à l'échelle locale (au sein des différents lacs) pour proposer les mesures de gestion adaptées.

Lakes and ponds of the Aquitaine Atlantic coast are unique natural ecosystems, not only at the national but also at the European scale. These systems host a high taxonomic diversity, especially for aquatic plants. Indeed, isoetid communities represent a set of species with high conservation value, also including one endemic species. These communities are however highly threatened, especially by anthropogenic activities, and most of the coastal Aquitaine's lakes have already experienced their extinction. Knowledge on these species is still however scarce, particularly concerning their genetic diversity. While conservation and restoration actions are emerging with the redaction of a National Plan for preserving these communities, understanding their genetic diversity, their relationships with taxonomic and functional diversity appear as a major issue. This doctoral project is based on 3 work packages. First, a comparative genetic diversity analysis of around 10 species of the community will be initiated and should give information about the distinct effect of historical and environmental variables on species demography. Second, the relationship between genetic and taxonomic diversity will be investigated and should deliver crucial information on biological interactions and metacommunity functioning. Finally, results will be considered within a conservation perspective, examining genetic isolation of protected species to suggest adapted management for their conservation.