Thèse en cours

Co-contribution de l'inflammation et de la biomécanique dans la régulation de l'axe « macrophage-fibroblaste-matrice » au cours de la mise en place et de la persistance de la fibrose tissulaire : comprendre pour mieux traiter.

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Auteur / Autrice : Yasmin El mahi
Direction : Céline Viennet-steinerGwenael Rolin
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie cellulaire
Date : Inscription en doctorat le 01/01/2023
Etablissement(s) : Besançon, Université Marie et Louis Pasteur
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Environnements, Santé (Dijon ; Besançon ; 2012-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Interaction hôte-greffon-tumeur et ingénierie cellulaire et génique
établissement de préparation : Université de Franche-Comté (1971-....)

Résumé

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La fibrose est un problème majeur de santé publique responsable d'environ 45% de la mortalité dans les pays industrialisés. Définie comme l'accumulation excessive de matrice extracellulaire (MEC), la fibrose est la conséquence d'un processus dérégulé de réparation tissulaire, souvent associé à une pathologie inflammatoire. Elle entraine une perte d'intégrité et de fonctionnalité de l'organe touché, puis potentiellement le décès du patient. Tous les organes peuvent être atteints par une fibrose, son étiologie est variable, et aucun traitement préventif ou curatif n'est aujourd'hui disponible. Notre projet ambitionne à élucider les mécanismes cellulaires et tissulaires responsables de la fibrose selon un axe « macrophage-fibroblaste-matrice »  comme prisme d'investigation et levier thérapeutique potentiel. Le rôle majeur du macrophage dans la fibrose fait consensus mais la dualité de son implication en fait un acteur complexe à étudier lorsqu'il interagit avec le fibroblaste, principal effecteur du dépôt de MEC. Les macrophages constituent une famille hétérogène et plastiques de cellules soit M1 pro-inflammatoires (TNFα, IL1β, IL-6…) ou M2 pro-résolutifs de l'inflammation (TGFβ, IL-10…). Le fibroblaste présente aussi ces mêmes caractéristiques, du point de vue phénotypique et fonctionnel (CD26, CD29, FAP, α-sm actin, collagen I…). En effet, durant la progression de la fibrose, le fibroblaste résident présente des propriétés inflammatoires et de dégradation de la matrice, puis un phénotype pro-fibrotique durant la phase de prolifération et de remodelage. Enfin, la MEC est aussi capable de réguler la fibrose à l'échelle cellulaire via la mécano-transduction et la modulation du matrisome. A notre connaissance, l'analyse multi-échelle de la fibrose du point de vue cellulaire, matricielle, inflammatoire et mécanique à la fois, n'a pas encore été documentée précisément. Pour atteindre les objectifs de ce projet, nous prendrons appui sur nos projets initiés avec le CHU de Besançon, le CIC Inserm 1431 et l'UMR Inserm 1098 sur la fibrose cutanée chéloïde (Etude Scar Wars NCT03312166, Projet Envergure Fibrolution, ANR PRCI S-Keloid). Ainsi, nous étendrons notre collection tissue-cellules pour mieux caractériser les signatures macrophagiques et fibroblastiques associées à la fibrose (histologie, single cell sequencing, micro-dissection laser…). Nous étudierons in vitro les interactions cellules-cellules-matrice sous le contrôle de stimuli mécaniques et inflammatoires combinés dans l'espace et dans le temps. Pour ce faire, nous modifierons nos modèles 3D dynamiques disponibles (gel de collagène, culture sur biomatériau, système Flexcell®) et les combineront à des méthodes d'analyse par microscopie real time (Incucyte, microscope holographique, confocal). Cette mise en œuvre permettra également d'obtenir le matériel nécessaire au décryptage des voies de signalisation impliquées et donc d'investiguer de nouveaux leviers thérapeutique de résolution de la fibrose. Certains font déjà l'objet actuellement de travaux préliminaires, l'un via la reprogrammation du macrophage et l'autre via des inhibiteurs d'arginase. A plus long terme, en collaboration avec l'ensemble de l'UMR, notre stratégie saura être transposée vers d'autres fibroses (pulmonaire, cardiaque, rénale…) pour éclaircir l'étiologie de celles-ci. Enfin, d'étroites interactions pourront être mises en œuvre avec la cancérologie, dans la mesure où les fibroblastes issus de fibroses non cancéreuses partageraient de grandes similitudes avec les fibroblastes associés au cancer (CAF).