ETUDE DE LA FITNESS DES GÈNES DANS LES BIOFILMS BACTÉRIENS EN CONDITIONS DEMICRO ET HYPERGRAVITE
Auteur / Autrice : | Hadi Jbara |
Direction : | Marie-Françoise Noirot-gros, Romain Briandet |
Type : | Projet de thèse |
Discipline(s) : | Microbiologie |
Date : | Inscription en doctorat le 01/12/2023 |
Etablissement(s) : | université Paris-Saclay |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Structure et dynamique des systèmes vivants (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 2015-....) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : MICALIS- Microbiologie de l'Alimentation au service de la santé humaine |
Référent : Faculté des sciences d'Orsay |
Mots clés
Résumé
Dans l'espace, les biofilms bactériens se développent sur toutes les surfaces, menaçant l'intégrité des équipements ainsi que la sécurité et la santé des équipages1,2. Plusieurs études ont mis en évidence, chez de nombreuses bactéries, une stimulation de la formation des biofilms en conditions de microgravité3,4. Comment les biofilms microbiens se forment dans l'espace et comment les contrôler sont des questions importantes qui nécessitent d'acquérir des connaissances fondamentales sur les éléments génétiques responsables de l'adaptation aux stress rencontrés en conditions de vol spatial. Cette étude consistera à identifier et à caractériser fonctionnellement les gènes clés impliqués dans la formation du biofilm sous différentes conditions de microgravités simulées, de type lunaire, martienne, ou encore telle que rencontrées à bord de l'ISS, ainsi qu'en condition d'hypergravité, chez deux espèces environnementales, la bactérie Gram-négative Pseudomonas fluorescens et la bactérie Gram-positive Bacillus subtilis. L'approche utilisée combinera des criblages génomiques par CRISPR (interférence), de la génétique, de la microfluidique et de l'imagerie confocale. La mise en uvre de ces approches sur des biofilms en condition de gravité altérée nécessitera l'accès aux installations expérimentales de l'ESA (e.g. ESTEC, Pays-Bas).