Thèse en cours

ETUDE DE LA FITNESS DES GÈNES DANS LES BIOFILMS BACTÉRIENS EN CONDITIONS DEMICRO ET HYPERGRAVITE

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Auteur / Autrice : Hadi Jbara
Direction : Marie-Françoise Noirot-grosRomain Briandet
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Microbiologie
Date : Inscription en doctorat le 01/12/2023
Etablissement(s) : université Paris-Saclay
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Structure et dynamique des systèmes vivants (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 2015-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : MICALIS- Microbiologie de l'Alimentation au service de la santé humaine
Référent : Faculté des sciences d'Orsay

Résumé

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Dans l'espace, les biofilms bactériens se développent sur toutes les surfaces, menaçant l'intégrité des équipements ainsi que la sécurité et la santé des équipages1,2. Plusieurs études ont mis en évidence, chez de nombreuses bactéries, une stimulation de la formation des biofilms en conditions de microgravité3,4. Comment les biofilms microbiens se forment dans l'espace et comment les contrôler sont des questions importantes qui nécessitent d'acquérir des connaissances fondamentales sur les éléments génétiques responsables de l'adaptation aux stress rencontrés en conditions de vol spatial. Cette étude consistera à identifier et à caractériser fonctionnellement les gènes clés impliqués dans la formation du biofilm sous différentes conditions de microgravités simulées, de type lunaire, martienne, ou encore telle que rencontrées à bord de l'ISS, ainsi qu'en condition d'hypergravité, chez deux espèces environnementales, la bactérie Gram-négative Pseudomonas fluorescens et la bactérie Gram-positive Bacillus subtilis. L'approche utilisée combinera des criblages génomiques par CRISPR (interférence), de la génétique, de la microfluidique et de l'imagerie confocale. La mise en œuvre de ces approches sur des biofilms en condition de gravité altérée nécessitera l'accès aux installations expérimentales de l'ESA (e.g. ESTEC, Pays-Bas).