Évaluation par des outils analytiques ultra-performants de l'influence de l'encombrement stérique sur les métalloenzymes de la matrice extracellulaire

Evaluation using powerful analytical tools of the steric influence on the metalloenzymes of the extracellular matrix

• Auteur / Autrice : Zahia Bouchelaghem
• Direction : Reine Nehme, Catherine Perrin
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Inscription en doctorat le 31/10/2022
• Etablissement(s) : Orléans
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire ; 2012-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de chimie organique et analytique (Orléans ; 2012-....)

Mots clés

Mots clés libres

Métalloenzymes

Matrice-extra cellulaire

Encombrement moléculaire

Cinétique

Metalloenzymes

Extracellular matrix

Molecular crowding

Kinetic

Résumé

La matrice extracellulaire (MEC) est essentielle pour le fonctionnement des organismes multicellulaires. Des maladies majeures, comme le cancer, sont associées à l'altération de son remodelage dynamique régulé par voie enzymatique. Cependant, celui-ci est encore peu compris au niveau théorique dans des conditions réalistes. La recherche liée à la MEC est importante, non seulement d'un point de vue fondamental, mais aussi pour un large éventail d'applications en biotechnologie et en médecine. Dans ce projet, nous étudierons comment la cinétique de certaines enzymes de la MEC est influencée par des milieux artificiels contrôlés ou des milieux contenant des composants clés de la MEC, qui sont aussi des substrats pour les enzymes, comme le collagène et l'acide hyaluronique. En partant de travaux collaboratifs préliminaires, nous réaliserons des analyses par spectroscopie UV/Vis, électrophorèse capillaire couplée entre autres à la mobilité ionique et à la spectrométrie de masse (CESI-IMS-MS) et RMN PFG sur des systèmes de complexité croissante.

The extracellular matrix (ECM) is essential for the functioning of the multicellular organisms. Major diseases, such as cancer, are associated with the alteration of its enzymatically regulated dynamic remodeling. However, this is still little understood at the theoretical level under realistic conditions. ECM-related research is important, not only from a fundamental standpoint but also for a wide array of applications in biotechnology and medicine. In this project, we will study how the kinetics of certain ECM enzymes are influenced by controlled artificial media including key ECM components, which are also substrates for the enzymes, such as collagen and hyaluronic acid. Starting from preliminary collaborative work, we will carry out analyzes by UV/Vis spectroscopy, capillary electrophoresis coupled among others with ion mobility and mass spectrometry (CESI-IMS MS) and NMR PFG on systems of increasing complexity.