Rôle du substrat dans la diversification de la flore Alpine : étude des mécanismes d'adaptation et de divergence

Substrate as a diversification driver in the Alpine flora : underlying mechanisms of adaptation and divergence

• Auteur / Autrice : Camille Voisin
• Direction : Philippe Choler
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biodiversité-Ecologie-Environnement
• Date : Inscription en doctorat le 30/09/2022
• Etablissement(s) : Université Grenoble Alpes
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale chimie et science du vivant (Grenoble ; 199.-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire d'ECologie Alpine

Mots clés

Mots clés libres

Spéciation

Substrat

Phylogéographie

Adaptation

Flore alpine

Adaptation

Phylogeography

Substrate

Alpine flora

Speciation

Résumé

De nombreuses études phylogéographiques et phylogénétiques portant sur la flore alpine montrent le rôle clé du substrat dans l'origine de cette flore, et en particulier dans le phénomène de spéciation (Choler et al. 2004, Alvarez et al. 2009, Boucher et al. 2016, 2021). Cependant, ces études reposent souvent sur des approches corrélatives et les mécanismes permettant la spéciation via l'adaptation à des substrats différents (Nosil 2012) n'ont jamais été étudiés directement chez la flore alpine. L'objectif de cette thèse sera d'étudier les mécanismes qui conduisent à l'apparition d'espèces adaptées à des substrats différents au sein de la flore alpine. Le principal modèle d'étude sera le tabouret à feuilles rondes (genre Noccaea, Brassicaceae). Il s'agit d'un groupe de micro-espèces se rencontrant dans les éboulis de haute altitude (>2000m) avec des variations morphologiques liées au substrat. La thèse vise à déterminer les mécanismes génétiques, physiologiques et les interactions plantes-microbes qui sous-tendent les adaptations au substrat et de comprendre comment ces adaptations peuvent conduire à l'isolement reproductif et à la spéciation.

Many phylogeographic and phylogenetic studies on the Alpine flora have shown the key role of substrate in the origin of this flora, and in particular on the process of speciation (Choler et al. 2004, Alvarez et al. 2009, Boucher et al. 2016, 2021). These studies however often rely on correlative approaches and the underlying mechanisms enabling speciation through adaptation to divergent substrates (Nosil 2012) have not been directly studied. The main goal of this PhD will be to study the mechanisms leading to the origin of species adpated to different substrates in the Alpine flora. Our model system will be the round-leaved pennycress (genus Noccaea, Brassicaceae), which is a complex of micro-species found in high-altitude screes (>2000m) growing on different substrates. The PhD aims to unravel the genetic and physiological mechanisms, as well as the plant-microbe interactions underlying adaptation to substrate, and to understand how these adaptations can lead to reproductive isolation and, ultimately, speciation.