Développement d'un nouveau procédé d'oligomérisation pour accéder à des mîmes fonctionnels et bio-inspirés de protéines présentant des motifs répétitifs d'acides aminés dans leurs séquences

Development of a novel oligomerization process to access bio-inspired and functional repeat protein mimics

• Auteur / Autrice : Eliott Roy
• Direction : Oleg Melnyk
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biomolécules, pharmacologie, thérapeutique - MED
• Date : Inscription en doctorat le 01/10/2022
• Etablissement(s) : Université de Lille (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre d'Infection et d'Immunité de Lille
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Biologie et Chimie des plathelminthes

Mots clés

Mots clés libres

Protéines

Ligation chimique

Activité anti-gel

Proteins

Chemical ligation

Anti-freeze activity

Résumé

Il est fréquent de rencontrer dans les séquences de protéines des motifs répétés d'acides aminés. En raison de l'implication de ces motifs dans de nombreuses propriétés physiques ou biologiques des protéines, nous proposons dans le projet de thèse de développer une méthode d'oligomérisation de fragments peptidiques, générale et efficace, permettant d'assembler en une étape et par ligations chimiques des polypeptides mimant ces structures répétitives. Partant d'une chimie récemment découverte dans l'équipe CBF, cette approche dont la faisabilité et le potentiel ont été mis en évidence lors d'expériences préliminaires nécessite d'être optimisée, que ce soit en solution ou sur support solide. Une fois son champ d'application et son mécanisme déterminés, cette réaction sera utilisée pour la préparation de mimes de protéines antigel, des composés présentant une forte valeur ajoutée dans de nombreux domaines, du fait de leur capacité à contrôler la croissance des cristaux de glace.

Proteins contain frequently in their sequence repeated motifs of amino acids. Since these motifs are connected to a wide range of physical and biological properties of proteins, we propose in the PhD project to develop a general and efficient method of peptide segments oligomerization that enables to assemble in one step and through successive chemical ligations polypeptides that mimic these repetitive structures. Based on a chemical tool recently discovered in the CBF team, this approach whose feasibility and potential was confirmed with preliminary experiments, needs to be optimized, either in solution or on solid support. Once its scope and its mechanism determined, the utility of this reaction will be demonstrated through the preparation of anti-freeze protein mimics, compounds that are highly valuable in wide range of areas due to their capacity to control ice crystal growth.