Thèse en cours

Connectivité génétique et diversité phénotypique des populations indigènes d'ombles de fontaine Salvelinus fontinalis (Mitchill 1814) de l'archipel de Saint-Pierre-et-Miquelon

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Auteur / Autrice : Julie Viana
Direction : Fabrice TeletcheaCéline Audet
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Ecotoxicologie, Biodiversité, Ecosystèmes
Date : Inscription en doctorat le 01/12/2021
Etablissement(s) : Université de Lorraine en cotutelle avec Université du Québec à Rimouski
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale SIReNa - Science et ingénierie des ressources naturelles
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : L2A_Laboratoire Animal et Agroécosystèmes

Résumé

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Sur l'archipel de Saint-Pierre et Miquelon (SPM), l'espèce emblématique des eaux douces est l'omble de fontaine, Salvelinus fontinalis (Mitchill, 1814). Les populations de ce salmonidé constituent une ressource alimentaire importante pour l'archipel et, plus largement, l'une des espèces de poissons les plus importantes pour la pêche sportive dans l'Atlantique Nord. Cependant, les populations indigènes ont subi un fort déclin ou ont disparu depuis le siècle dernier, principalement en raison de la fragmentation et/ou de la perte d'habitats viables et de la surpêche (Ryther, 1997). Celles de SPM ne semblent pas faire exception (Viana et al., 2022). La gestion des petites populations est une mesure essentielle pour la sauvegarde de l'espèce, en particulier dans un contexte de pressions anthropiques et environnementales croissantes (Segelbacher, 2021). Ces populations d'ombles reflètent également les changements climatiques passés en Amérique du Nord (Magnan, 2002). Leur conservation est importante, car elles sont le résultat de nombreux processus évolutifs qui ont forgé la variabilité et la plasticité morphologique, écologique et génétique de cette espèce. Sur l'archipel, très peu d'informations existent sur ces populations. L'objectif de ce projet de recherche est de mieux les caractériser en explorant pour la première fois leur diversité et leur structure génétique à l'aide de marqueurs microsatellites couramment utilisés chez cette espèce. Leur potentiel adaptatif et aquacole sera ensuite étudié à l'aide de la transcriptomique. Ces deux objectifs prendront en compte trois échelles d'étude : les îles, les rivières et les positions au sein de ces rivières. Ces recherches sont un prérequis pour améliorer la gestion de la pêche sportive dans ces îles, notamment en relation avec les changements globaux qui impactent fortement l'archipel, et favoriser le développement d'un programme d'enrichissement pour améliorer le nombre et la taille des poissons pour la pêche sportive et la consommation humaine.