Identification et caractérisation de glycosidases impliquées dans le remodelage de la paroi des mycobactéries

Identification and characterization of glycosidases involved in the remodeling of the wall of mycobacteria

• Auteur / Autrice : Réginald Lefebvre
• Direction : Yann Guérardel
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences de la vie et de la santé - FST
• Date : Inscription en doctorat le 01/10/2020
• Etablissement(s) : Université de Lille (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : École graduée Biologie-Santé (Lille ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : UGSF - Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Chemical Glycobiology

Mots clés

Mots clés libres

Glycosidases

Implication

Remodelage

Paroi

Mycobactérie

Glycosidases

Involvement

Remodeling

Wall

Mycobacteria

Résumé

L'enveloppe cellulaire des mycobactéries est une entité complexe qui joue un rôle majeur dans la pathogénicité des espèces infectieuses comme Mycobacterium tuberculosis. Des modifications de sa structure sont indispensables lors de la croissance et division cellulaire ou pour l'adaptation au milieu extérieur, notamment dans le cadre des relations hôte-pathogène. Les acteurs de ce remodelage, principalement des hydrobases, sont donc des éléments clés dans la recherche et le développement de nouveaux traitements. Ce projet de recherche vise à donc identifier et caractériser de nouvelles glycosidases mycobactériennes pouvant être impliquées dans le remodelage de la paroi de ces bactéries. La découverte de ces nouvelles glycosidases utilisera une combinaison de stratégies reposant principalement sur l'isolement d'activités relevantes par rapport aux structures glycanniques associées à la paroi, la co-purification de glycosidases associées et la recherche dans les banques de séquences. Les paramètres cinétiques et enzymatiques des protéines candidates seront ensuite déterminés. Conjointement, la structure précise des substrats et produits de ces enzymes sera aussi établie. La caractérisation fonctionnelle de ces enzymes sera d'abord abordée par l'étude de leur expression afin de pouvoir les relier à un des aspects de la physiologie des mycobactéries. Cette étape préliminaire permettra ensuite de concevoir l'expérimentation nécessaire pour prouver la fonction de la protéine incriminée. L'ensemble de ces travaux devrait permettre de poser les bases du rôle des glycosidases spécifiques de l'enveloppe cellulaire mycobactérienne.

The cell envelope of mycobacteria is a complex entity that plays a major role in the pathogenicity of infectious species such as Mycobacterium tuberculosis. Changes in its structure are essential during cell growth and division or for adaptation to the external environment, particularly in the context of host-pathogen relationships. The players in this remodeling, mainly hydrobases, are therefore key elements in the research and development of new treatments. This research project therefore aims to identify and characterize new mycobacterial glycosidases that may be involved in the remodeling of the cell wall of these bacteria. The discovery of these new glycosidases will use a combination of strategies based mainly on the isolation of relevant activities with respect to the glycan structures associated with the wall, the co-purification of associated glycosidases and the search in sequence banks. The kinetic and enzymatic parameters of the candidate proteins will then be determined. Together, the precise structure of the substrates and products of these enzymes will also be established. The functional characterization of these enzymes will first be approached by studying their expression in order to be able to relate them to one of the aspects of the physiology of mycobacteria. This preliminary step will then allow the design of the experiment necessary to prove the function of the incriminated protein. All of this work should lay the foundations for the role of specific glycosidases in the mycobacterial cell envelope.