Thèse en cours

Etude des réseaux bactériens autour des bactéries virulentes dans la carcinogenèse digestive
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Auteur / Autrice : Mohammad Sadeghi
Direction : Iradj SobhaniDenis Mestivier
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie cellulaire et moléculaire
Date : Inscription en doctorat le 15/12/2021
Etablissement(s) : Paris 12
Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale Sciences de la Vie et de la Santé
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : EC2M3 Early detection of Colonic Cancer by using Microbial & Molecular Markers
Equipe de recherche : Early detection of Colonic Cancer by using Microbial & Molecular Markers” (EC2M3)

Mots clés

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Résumé

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Le cancer colorectal (CCR), le troisième plus fréquent en France chez deux sexes, résulte du cumul successif de modifications d'ADN. Celles-ci ont pour conséquence une désorganisation génétique des cellules coliques jusqu'à un point de non-retour à la normale. Ce processus est d'autant accéléré qu'il existe une anomalie du système MMR (MisMatch Repair) d'ADN. Ces anomalies géniques peuvent être sporadiques ou constitutionnelle dans respectivement 95% et un peu moins de 5% des CCR. Le terrain génétique constitutionnel connu sous le nom de syndrome de Lynch qui augmente le risque de survenu des lésions précancéreuses colique et du CCR se caractérise par une altération du système MMR. Il est désormais démontré que les modifications de facteurs environnementaux sont à l'origine du processus carcinogène chez le sujet indemne de telles anomalies génétiques constitutionnelles. C'est par le microbiote que se fait le lien entre l'environnement et la muqueuse colique. La symbiose entre les bactéries du microbiote et notre muqueuse colique a été étudiée à partir de l'analyse de selles par de nombreuses équipes dont l'équipe de Pr. SOBHANI au sein du Lab. EC2M3-EA7375 à l'UPEC. Le rôle des bactéries pro-inflammatoires virulentes au sein des bactéries associées à la lumière et aux muqueuses a été distingué en tant qu'acteurs conducteurs et passagers dans l'initiation, la promotion et la réponse des tumeurs aux thérapies. Récemment, nous avons eu l'occasion de caractériser le microbiote de 150 patients atteints d'un syndrome de Lynch dont 50% porteurs de lésions coliques et apporter une analyse d'associations bactériennes liées aux évènements survenus dans le colon. Dans la continuité de ces travaux, nous planifions d'e comparer cette cohorte et celles de sujets atteints de CCR sporadiques d'une part et celle des patients sous traitement (avant et après la chirurgie curatrice) et de suivi et éventuellement de prise en charge de récidive de type chimiothérapie. Outre les liens entre différentes étapes de cancérogenèse avec diverses communautés bactériennes coliques, l'efficacité des thérapies anticancéreuses, sous l'influence du microbiote, sera abordée et/ou chirurgie curative de rattrapage. Nous examinerons l'intervention des réseaux bactériens pathogènes pro-inflammatoires en tant que communauté bactérienne pivote dans le stade précoce comme événement de « Starter » dans la dysbiose liée au CCR. Compte tenu des analyses simultanées tissulaires, métabolomiques, et transcriptomiques, nous mettrons en exergue les réseaux ainsi caractérisés avec les réponses (ARN, Métabolites sériques, fécaux et urinaires) de l'hôte afin de définir de nouvelle voie d'activation carcinogène et d'en dégager des points cibles de contrôle ou de freinage.