Pollution zéro: recyclage de coproduits de l'activité conchylicole - Recherche de biomolécules bactéricides dans la coquille de mollusques d'intérêt économique.

Zero pollution: recycling sea by-products of shellfish farming - Search for bactericidal biomolecules in the shell of mollusks of economic interest.

• Auteur / Autrice : Camille Lutet-toti
• Direction : Frédéric Marin, Stefano Goffredo, Giuseppe Falini
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie des organismes
• Date : Inscription en doctorat le 01/11/2021
• Etablissement(s) : Dijon, Université Bourgogne Europe en cotutelle avec Université de Bologne
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Environnements, Santé (Dijon ; Besançon ; 2012-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Biogéosciences (Dijon)

Mots clés

Mots clés libres

Mollusque

Matrice coquillère

Bactericide

Coquille

Biominéralisation

Shell

Bactericide

Biomineralization

Shell matrix

Mollusc

Résumé

Pour calcifier leur coquille, les mollusques sécrètent des macromolécules (essentiellement des protéines) qui contrôlent la mise en place des unités cristallines et restent incluses dans la phase minérale. Les techniques haut-débit de protéomique adossée à des transcriptomes montrent toute la complexité de cette matrice calcifiante, douée de nombreuses fonctions moléculaires, parmi lesquelles de potentielles fonctions bactéricides, révélées par la présence de peptides très basiques contenus dans la matrice. Ce projet exploratoire cherche en premier lieu à démontrer in vitro la capacité bactéricide de matrices calcifiantes coquillières extraites de mollusques d'intérêt économique (moule, huître, praire, coquille St-Jacques, amande de mer, etc...), et en second lieu, à tester leur efficacité à enrayer la bioérosion de géomatériaux carbonatés par des microorganismes endolithes, notamment des cyanobactéries perforantes. Ce projet de recherche se situe à l'interface des géosciences de l'environnement, de l'aquaculture et bien évidemment de la santé, mais également de la muséologie et des sciences de la conservation du patrimoine. Il vise de plus à valoriser - par une application sophistiquée - des coproduits de la mer très abondants, les coquilles vides issues de la consommation courante, qui font uniquement l'objet de recyclages à faible valeur ajoutée (amendement des sols, compléments alimentaires aviaires, remblais côtiers) : ainsi, ce projet ambitionne, à moyen terme, de mettre en place une économie circulaire vertueuse.

To calcify their shells, molluscs secrete macromolecules (mainly proteins) that regulate the setting up of the crystalline units and remain included in the mineral phase. High-throughput proteomics techniques backed by transcriptomes show the complexity of this calcifying matrix, which has many molecular functions, including potential bactericidal power revealed by the presence of highly basic peptides contained in the matrix. This exploratory project first seeks to demonstrate in vitro the bactericidal capacity of calcifying shell matrices extracted from molluscs of economic interest mussel, oyster, prairie, scallop, sea almond, etc.); then, to test their effectiveness in stemming the bioerosion of carbonated geomaterials by endolithic microorganisms, in particular perforating cyanobacteria. This research project is at the interface of environmental geosciences, aquaculture and health, but also of museology and cultural heritage conservation sciences. Its purpose is to valorise - through a sophisticated application – a very abundant co-product of the sea : the empty shells from common shellfish consumption which are only recycled with low added value (soil amendment, poultry feed supplements, coastal embankments). Thus, in the medium term, this project aims to establish a virtuous circular economy.