Caractérisation fonctionnelle et structurale des usines virales du virus respiratoire syncytial

Functional and structural characterization of the respiratory syncytial virus' viral factories

• Auteur / Autrice : Vincent Basse
• Direction : Marie Galloux
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Inscription en doctorat le 01/12/2021
• Etablissement(s) : université Paris-Saclay
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Structure et Dynamique des Systèmes Vivants
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Virologie et immunologie moléculaire (VIM)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Biologie moléculaire des Pneumovirus
• Partenaire(s) de recherche : référent : Université de Versailles-Saint-Quentin-en-Yvelines (1991-....)

Mots clés

Mots clés libres

Virus respiratoire syncytial

Usine virale

Partenaires cellulaires

Corps d'inclusion

Nucléoprotéine

Respiratory syncytial virus

Viral factory

Host interactions

Inclusion bodes

Nucleoprotein

Résumé

Le virus respiratoire syncytial (VRS) est principal agent infectieux responsable d'infections respiratoires aigües chez les enfants en bas âge, mais également chez les personnes âgées et immunodéprimées. A ce jour, il n'existe aucun vaccin ni aucun traitement spécifique contre ce virus. Seul un traitement préventif (Palivizumab) est disponible, mais sa faible efficacité et son coût élevé (5000 euros) en limite l'utilisation. Le développement de nouvelles stratégies antivirales nécessite une meilleure compréhension du cycle viral. Les étapes de réplication et transcription du VRS ont lieu dans le cytoplasme de la cellule infectée, au sein de structures sphériques dépourvues de membranes et viro-induites, nommées corps inclusion (ou IBs pour "inclusion bodies"). Au sein de ces structures sont retrouvées l'ensemble des protéines du complexe polymérase viral (la polymérase L, son co-facteur P, la nucléoprotéine encapsidant le génome viral, et le facteur de transcription M2-1). La morphogénèse de ces IBs repose sur un mécanisme d'exclusion de phase, dépendant des interactions entre les protéines N et P. Différentes protéines cellulaires, notamment impliquées dans la transcription ou dans le contrôle des voies d'immunité innée sont également recrutées dans ces structures. Le présent projet (financé dans le cadre de l'ANR AAP2021 RSVFact) vise à i/ caractériser l'organisation et la dynamique des IBs, et ii/ identifier les partenaires cellulaires associés à ces structures et définir le rôle de ce recrutement au cours du cycle viral. L'obtention de telles données devrait permettre le développement de nouvelles stratégies antivirales visant à inhiber la formation de ces structure et/ou leur fonctionnement.

The respiratory syncytial vurs (RSV) is a main infectious pathogen responsible for acute respiratory infections in young children, but also in the elderly and immunodepressed patients. To this day, no vaccine, nor any specific treatment against this virus exist. Only a preventive treatment (Palivizumab) is available, but its low efficiency and its high cost (5000 euros) limit its use. The development of new antiviral strategies necessit a better understanding of the viral cycle. The replication and transcription steps of RSV take place in the cytoplasm of the infected cell, inside spherical, membrane-less, viro-induced structures, called inclusion bodies (IBs). Inside these structures can be found the entirety of proteins from the viral polymerase complex (polymerase L, its cofactor P, the nucleoprotein englobing the viral genome, as well as the transcription factor M2-1). Morphogenesis of these IBs relies on a phase exclusion mechanism, which is dependent on interactions between proteins N and P. Different cellular proteins, among which many play a role in transcription or in the control of innate immune response pathways, are also recruted to these structures. This project (funded by the ANR AAP2021 RSVFact project) aims to i/ characterize IB organization and dynamics, and to ii/ identify cellular partners associated to these structures and define the purpose of these recruitments during the viral cycle. The obtention of such data should allow the development of new antiviral strategies aiming to inhibit the formation of these viral structures and/or their functioning.