Thèse en cours

Biologie structurale in-cell à l'échelle atomique par résonance magnétique : étudier l'inhibition de cibles anti-caner, les kinases, dans l'environnement natif
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Auteur / Autrice : Hélène Cherot
Direction : François-Xavier Theillet
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie structurale
Date : Inscription en doctorat le 01/10/2021
Etablissement(s) : université Paris-Saclay
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Innovation thérapeutique : du fondamental à l'appliqué
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
Equipe de recherche : Fonction et architecture des assemblages macromoléculaires
référent : Faculté de pharmacie

Résumé

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Nous avons développé récemment des méthodes innovantes en RMN pour l'étude structurale des protéines directement en cellulevivante. La RMN a la capacité unique, par rapport à la cryoEM et la cristallographie, d'observer à l'échelle atomique la structure « in-cell » d'une protéine grâce au filtre isotopique 15N ou 13C. L'étudiant(e) en thèse caractérisera des kinases cibles pharmaceutiques validées par cette technique. Ces développements seront ouverts via la plateforme RMN FRISBI de Paris-Saclay aux laboratoires académiques et privés.Les kinases régulent le destin cellulaire et sont impliquées dans les cancers, les maladies autoimmunes ou neurodégénératives. Elles ont souvent plusieurs états d'activation avec plusieurs conformations stables : quel est l'impact du milieu cellulaire sur ces équilibres ? sur l'interaction avec des inhibiteurs ? Nous répondrons à ces questions par RMN in cell.Nous produirons les kinases p38a, CDK1 et CK1a en cellules d'insectes et mammifères, en intégrant un nouveau marquage isotopique produisant un signal amplifié nécessaire pour la RMN en cellule. Nous utiliserons ce savoir-faire i) pour la compréhension fondamentale des kinases et ii) pour de nouvelles approches pour le screening et la conception de médicaments.