Thèse en cours

Marquage isotopique pour la métabolomique quantitative
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Auteur / Autrice : Jérémy Monteiro
Direction : Patrick Emond
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Sciences de la Vie et de la Santé
Date : Inscription en doctorat le 01/11/2021
Etablissement(s) : Tours
Ecole(s) doctorale(s) : Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant - SSBCV
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Imagerie et cerveau
Equipe de recherche : Equipe 3 - Imagerie, Biomarqueurs et Thérapeutique

Résumé

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La métabolomique cherche à définir la composition complète des métabolites de faible poids moléculaire dans les échantillons biologiques. Cette science se développe en raison de son potentiel d'identification de biomarqueurs pour suivre l'évolution d'un individu, pour détecter une pathologie le plus tôt possible et pour prédire et suivre la réponse au traitement. A ce jour, la métabolomique en reste à ses balbutiements dans sa capacité à décrire quantitativement le métabolome (le plus exhaustivement possible) au niveau d'un individu (multicompartiment) tout en respectant les prérequis d'une utilisation courante en biologie médicale (robustesse, contrôles qualité ...), ce qui limite son utilisation dans le domaine médical. L'objectif général de ce projet est de développer des étiquettes chimiques (Tag) innovantes pour la détection quantitative du métabolome le plus exhaustivement possible. Les objectifs spécifiques de ce travail sont : 1) La synthèse et optimisation de Tag (ICOA et IBrain). Ces Tag (molécules composées d'une partie marquable par un isotope stable (2H, 13C) et sensible pour une détection en spectrométrie de masse ainsi que d'une partie réactionnelle) devront marquer une diversité moléculaire importante pour une couverture métabolomique la plus large possible. Les Tag les plus intéressants seront marqués par isotopes stables. 2) L'évaluation de ces Tag pour le marquage de métabolome biologiques : sang, urines (IBrain). 3) La validation de l'utilisation de ces Tag pour la quantification absolue dans le but de générer des données quantitatives de référence sur des individus sains (IBrain).