Thèse en cours

Etude de l'implication de PB1-F2 dans la pathogénicité, l'émergence et la transmissibilité des virus Influenza de Type A
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Auteur / Autrice : Elise Bruder
Direction : Christophe Chevalier
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie moléculaire et cellulaire
Date : Inscription en doctorat le 30/09/2021
Etablissement(s) : université Paris-Saclay
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Structure et Dynamique des Systèmes Vivants
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Virologie et immunologie moléculaire (VIM)
référent : Université de Versailles-Saint-Quentin-en-Yvelines (1991-....)

Résumé

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Les virus influenza de type A constituent un défi constant en matière de santé humaine et animale. La diversité d'hôtes qu'ils peuvent infecter et la fréquence des transmissions inter-espèces maintiennent la menace de l'émergence de souches capables de se transmettre à l'homme et pouvant conduire à une pandémie. Depuis 2013, les virus réssortants H5Nx (dérivés de la clade 2.3.4.4 des virus HPAI H5N1) se disséminent de manière panzootique de par le monde. En France, la souche H5N8 a provoqué l'abattage de millions de canards conduisant à d'importante perte économique pour la filière avicole. Notre projet vise à contribuer à une meilleure compréhension de l'émergence de virus réassortants et notamment de l'implication du segment 2, codant PB1, la polymérase virale et le facteur de virulence PB1-F2. Profitant de l'épisode de réassortiment H5N8, nous proposons de combiner différentes approches pour étudier cet évènement qui se déroule en ce moment sur le terrain: une analyse phylogénétique des segments 2 des virus de grippe aviaire et la caractérisation de son habilité à émerger au cours des événements de réassortiment, l'étude du rôle de PB1-F2 dans la pathogénicité et la capacité de transmission des virus réassortants (à l'aide de H5N8 Tarn et de ces variants exprimant ou pas PB1-F2 générés grâce au système de génétique inverse H5N8). La propension de fibrillation des PB1-F2 d'origine aviaire sera testée in vitro. A l'aide de modèle d'infection en canard et souris, le potentiel pathogène de PB1-F2 et la réponse inflammatoire de l'hôte sera analysée afin d'apporter de nouvelles informations visant à comprendre le mécanisme d'action de PB1-F2. Enfin, nous tenterons de détecter la présence de fibres de PB1-F2 à l'échelle cellulaire ainsi que dans des modèles animaux (tissus infectés) à l'aide de méthodes totalement innovantes (expérinces synchrotron).