Étude du profil du microbiote intestinal chez les patients atteints d'une hépatite alcoolique aiguë sévère

Study of intestinal microbiota in patients with seve acute alcoholic hepatitis

• Auteur / Autrice : Damien Esparteiro
• Direction : Ingrid Marcq, Eric Nguyen-khac
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie-Biologie Cellulaire et Moléculaire, Microbiologie-101326
• Date : Inscription en doctorat le 22/09/2021
• Etablissement(s) : Amiens
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences, Technologie, Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Groupe de recherche sur l'alcool et les pharmacodépendances (Amiens)

Mots clés

Mots clés libres

Hépatite alcoolique aigue

Microbiote

Dysbiose

Transfert de Microbiote Fécal

Acute alcoholic hepatitis

Microbiota

Dysbiosis

Faecal Microbiota Transfer

Résumé

La maladie alcoolique du foie est une conséquence fréquente d'un usage excessif et chronique d'alcool. Le risque hépatique présent chez les 6 millions de consommateurs excessif d'alcool est de 10 fois supérieur à celui causé par les virus VHC et VHB ensemble. L'une de ses formes les plus sévères est l'Hépatite Alcoolique Aigüe sévère(HAAs), avec une mortalité de 30 à 40% à 1 mois. Cette pathologie se caractérise par une inflammation hépatique généralisée, entretenue par une translocation bactérienne du système digestif vers le système porte. La dysbiose intestinale induite par l'alcool aurait ainsi un rôle prépondérant dans les mécanismes physiopathologiques de l'HAAs. D'un point de vue thérapeutique, l'unique traitement est la corticothérapie (± N-acetylcysteine). Cependant, un tiers des patients sont non-répondeurs à ce traitement et se retrouvent en impasse thérapeutique. Actuellement, cette réponse est évaluée par le calcul du score de Lille après 7 jours de thérapie. L'objectif principal du doctorat est d'étudier les profils microbiotiques intestinaux des patients ayant une HAAs dès leur admission à l'hôpital afin d'y détecter une biosignature capable de prédire la réponse du malade aux corticoïdes. Les échantillons fécaux seront prélevés au jour 0 et conservés à -80°C à la Biobanque de Picardie du CHU d'Amiens. L'extraction de l'ADN microbiotique des selles des patients sera réalisée pour l'étude de plusieurs phyla d'intérêt comme Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobactéries et Protéobacteries à l‘aide de la technique de PCR quantitative, et par séquençage d'amplicons microbiens. De plus, nous utiliserons un modèle préclinique murin d'HAAs afin d'identifier les mécanismes immunomodulateurs de la Transplantation de Microbiote Fécal (TMF) dans l'HAAs et de comprendre les mécanismes de résistance à la corticothérapie des patients HAAs non répondeurs. La TMF pourrait s'avérer une solution thérapeutique pour les patients HAAs.

Alcoholic liver disease is a common consequence of chronic excessive alcohol use. The liver risk found in 6 million heavy drinkers is 10 times greater than that represented by the HBV and HCV viruses together. One of its most severe forms is Acute Alcoholic Hepatitis (AAH), with 30-40% mortality at 1 month. This pathology is characterized by generalized liver inflammation, maintained by bacterial translocation from the digestive system to the portal system. Alcohol-induced intestinal dysbiosis is thought to have an important place in pathophysiological mechanisms of AAH. From a therapeutic point of view, the only treatment is corticosteroid therapy (± N-acetylcysteine). However, a third of the patients are non-responders to this therapy according to the Lille score evaluated on the 7th day of treatment. These patients find themselves in a therapeutic impasse. The main objective is to study the gut microbiotic profiles of patients with AAH admitted to hospital in order to determine a biomarker of their response to corticotherapy. Stool samples will be obtained at day 0 and frozen at -80°C in the Picardie's Biobank, at Amiens Hospital. Microbiotical DNA extraction will be carried out to study some phyla of interest such as Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria and Proteobacteria through quantitative PCR and microbial amplicons sequencing. In addition, we will use a murine preclinical model to identify the immunomodulatory mechanisms of Faecal Microbiota Transfer (FMT) in HAA and to understand the mechanisms of resistance to corticosteroid therapy in unresponsive AAH patients. FMT may be a therapeutic solution for AHH patients.