Thèse en cours

Mécanismes d'actions des défensines
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Auteur / Autrice : Ons Kharrat
Direction : Céline Landon
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie
Date : Inscription en doctorat le 01/10/2021
Etablissement(s) : Orléans
Ecole(s) doctorale(s) : Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant - SSBCV
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : CBM - Centre de Biophysique Moléculaire

Résumé

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La résistance aux antibiotiques constitue aujourd'hui un réel problème de santé public dont les prévisions annoncent plus de 10 millions de morts par an en 2050. Les peptides antimicrobiens (PAMs), produits naturellement par tout organisme vivant, et optimisés au cours de l'évolution, sont l'une des alternatives les plus prometteuses aux antibiotiques, moins propices à l'acquisition rapide de résistance. Parmi les PAMs, nous nous intéressons à deux familles de défensines, petites protéines cationiques riches en ponts disulfures. L'objectif de cette thèse est de disséquer leurs mécanismes d'actions au niveau atomique, ce qui est une étape indispensable dans la conception d'une nouvelle génération d'antibiotiques. Pour la défensine antifongique ETD151, issue de papillons, nous étudierons son interaction avec un composant (Glucosylcéramide) spécifique de la membrane fongique, et identifié comme cible dans la 1ère étape de son mécanisme. Après avoir isolé et caractérisé les principaux GlcCers du champignons phytopathogène Botrytis cinerea, nous étudierons l'interaction moléculaire in vitro, dans des modèles de membranes, par plusieurs techniques complémentaires (MST, ITC, RMN, …) Pour la défensine antibactérienne AvBD103b du manchot Royal, nous travaillerons sur des bactéries vivantes, par microscopie de fluorescence en temp réel (Plateforme P@cyfic, CBM). Ces expériences nous permettrons de suivre en temps réel la localisation de la défensine au cours du mécanisme et d'identifier les potentiels partenaires.