Etude génomique des interactions entre métabolismes musculaire et digestif : rôle dans le contrôle des réserves énergétiques chez le poulet de chair

Genomic study of the interactions between muscular and digestive metabolisms: role in the control of energy reserves in broiler chickens.

• Auteur / Autrice : Philippe Bochereau
• Direction : Elisabeth Duval, Cécile Berri
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences de la Vie et de la Santé
• Date : Inscription en doctorat le 04/10/2021
• Etablissement(s) : Tours
• Ecole(s) doctorale(s) : Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant - SSBCV
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : BOA - Biologie des Oiseaux et Aviculture

Mots clés

Mots clés libres

Poulet

Muscle

Glycogène

Transcriptome

Génétique

Digestion

Chicken

Muscle

Glycogen

Transcriptome

Genetics

Digestion

Résumé

Chez le poulet, les réserves en glycogène jouent un rôle déterminant sur l'intégrité musculaire et la qualité de la viande. S'il existe un fort déterminisme génétique de ce caractère, les gènes et les mutations à l'origine de sa variation restent à élucider de même que les voies biologiques impliquées au niveau de l'animal. Récemment, plusieurs travaux chez l'homme et la souris ont fait état d'un lien entre fonctionnalité musculaire et microbiote intestinal, mettant en lumière le rôle de la fonction digestive et de l'assimilation des nutriments dans l'élaboration de phénotypes musculaires tels que les réserves en glycogène. Ce dialogue entre sphère digestive et métabolisme musculaire sera étudié au sein d'un modèle génétique unique de deux lignées divergentes de poulet sélectionnées pour le pH ultime du filet, reflet des réserves en glycogène du muscle. L'approche expérimentale mise en œuvre consistera en une analyse intégrée des transcrits musculaires et digestifs obtenus par RNAseq, ainsi que des phénotypes mesurés sur les mêmes animaux. Elle visera d'une part à mieux comprendre les processus biologiques liés à la digestion, l'absorption, le transport et l'utilisation métabolique des nutriments associés à la variabilité des réserves en glycogène, et d'autre part à détecter des polymorphismes génétiques pouvant contribuer à leur régulation.

In chicken, glycogen reserves play a determining role in muscle integrity and meat quality. While there is a strong genetic determinism of this trait, the genes and mutations at the origin of its variation remain to be elucidated as well as the biological pathways involved. Recently, several studies in humans and mice have shown a link between muscle function and intestinal microbiota, highlighting the role of digestive function and nutrient assimilation in the development of muscle phenotypes such as glycogen reserves. This dialogue between the digestive sphere and muscle metabolism will be studied within a unique genetic model of two divergent chicken lines selected for the ultimate pH of the breast, reflecting the muscle glycogen reserves. The experimental approach will consist in an integrated analysis of muscle and digestive transcripts obtained by RNAseq, as well as phenotypes measured on the same animals. It will aim on the one hand to better understand the biological processes related to the digestion, absorption, transport and metabolic use of nutrients associated with the variability of glycogen reserves, and on the other hand to detect genetic polymorphisms that may contribute to their regulation.