Caractérisation et typologie de la distribution spatiale et la variabilité temporelle fine des communautés phytoplanctoniques à partir d'approches automatisées : bilan intégré Manche et sud Mer du Nord

Characterisation and typology of the spatial distribution and temporal variability, at fine scale, of phytoplankton communities from automated approches : integrated assessment in the Channel and southern North Sea

• Auteur / Autrice : Zéline Hubert
• Direction : Sébastien Monchy, Luis-felipe Artigas
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences de la Mer - Biologie et écologie
• Date : Inscription en doctorat le 27/08/2021
• Etablissement(s) : Littoral
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences, Technologie, Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : LOG - Océanologie et Géosciences

Mots clés

Mots clés libres

Phytoplancton

Manche - Mer du Nord

Approches automatisées

Distribution spatiale

Variabilité temporelle

Phytoplankton

English Channel - North Sea

Automated approaches

Spatial distribution

Temporal variability

Résumé

Le suivi du compartiment phytoplanctonique à des échelles d'observation compatibles avec sa dynamique est capitale pour la caractérisation et compréhension du fonctionnement des écosystèmes marins dans le contexte de changement global et d'impacts anthropiques multiples. Pour cela, des approches automatisées ont été déployées au cours de la dernière décennie au sein de navires ou plateformes fixes via l'utilisation de capteurs basés sur les propriétés optiques ainsi que d'outils de traitement automatisés de données, permettant une approche fonctionnelle de ce compartiment à haute résolution spatiale et temporelle. En parallèle, le déploiement de techniques moléculaires a permis d'atteindre une résolution taxonomique fine sur des sites sélectionnés pour leurs caractéristiques écologiques ou hydrologiques d'intérêt. Le travail de doctorat consistera à avancer dans la compréhension de la diversité et dynamique phytoplanctonique à partir d'une analyse et un bilan des suivis combinés de ces communautés en Manche et sud Mer du Nord au cours de la dernière décennie, complétées par des actions ciblées d'observation à haute résolution menées à des moments et dans des zones critiques de changement de communautés. Une participation active aux initiatives nationales et internationales de définition de pratiques opérationnelles et d'application d'outils de traitement et d'analyse automatisés contribuera à l'intégration de données interopérables et inter comparables au calcul d'indicateurs de surveillance des écosystèmes pélagiques, d'alimenter des modèles biogéochimiques et des algorithmes de télédétection satellite et, de ce fait, contribuer à une meilleure compréhension des grands bilans à l'échelle mondiale du fonctionnement des systèmes pélagiques.

Monitoring phytoplankton at scales of observation that encompasses their dynamics, is essential for characterizing and understanding the functioning of marine ecosystems in the frame of global change and multiple anthropic pressures. Automated approaches have been applied during the last decade in both research/opportunity vessels and fixed stations/moorings, through the deployment of sensors based on optical properties and the application of novel automated data analysis, allowing a functional approach at high spatial and temporal resolution of this compartment. In parallel, the implementation of molecular techniques made it possible to reach a a higher taxonomical resolution in selected sites of particular hydrological and ecological characteristics. The doctorate work will contribute to better understanding of phytoplankton diversity and community dynamics by analysing automated and molecular data associated to observation and monitoring networks mainly in the Channel and southern North Sea during the last ten years, as well as data collected during dedicated research inthe area, complemented with some new high frequency studies carried out targeting some crucial critical periods/areas of changes inphytoplankton communities. He/she will participate in national and international work for defining best practices for automated techniquesas well as improvements of automated software tools for the treatment and analysis of data. It will facilitate the integration of novel data forthe calculation of pelagic habitats indicators, as well as data integration into biogeochemical models and water colour algorithms,contributing to moving forward with the wide scale assessment of the functioning and trends of marine pelagic systems