interactions hôte / Candida au cours des péritonites fongiques graves de réanimation

interactions host / Candida during intra-abdominal candidiasis

• Auteur / Autrice : Emmanuel Novy
• Direction : Anne Debourgogne, Marie-Reine Losser
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences de la Vie et de la Santé - BioSE
• Date : Inscription en doctorat le 10/11/2020
• Etablissement(s) : Université de Lorraine
• Ecole(s) doctorale(s) : BioSE - Biologie Santé Environnement
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : SIMPA - Stress, Immunité, Pathogènes

Mots clés

Mots clés libres

Péritonite fongique

Candida

Expression génique

Immunité

Stress

Réanimation

Intra abdominal candidiasis

Candida

Genomic

Immunity

Stress

Critically ill

Résumé

La péritonite fongique à Candida en réanimation est une pathologie grevée d'une morbi-mortalité élevée. A ce jour, on ne sait pas si cette mortalité élevée est directement imputable à Candida ou si le fait d'isoler du Candida dans le liquide péritonéal est un témoin indirect de la gravité sous-jacente et/ou du terrain du patient. Une des sources de la controverse relève du pathogène lui-même : la levure Candida est un pathogène de la flore commensale du tube digestif qui lui confèrerait un statut de colonisant. Sur la base d'autres pathologies cliniques impliquant Candida, ce postulat nécessite un microbiote et des défenses immunitaires intacts. L'hypothèse de recherche est que, dans les péritonites, Candida passe d'un statut de pathogène colonisant à infectant sous l'influence d'un stress environnemental représenté par le liquide péritonéal et les coinfections bactériennes. L'objectif principal de cette thèse est de montrer le changement de statut de Candida par une approche multimodale phénotypique, moléculaire (expression de gène impliqué dans sa pathogénicité) et métabolique à partir de prélèvements microbiologiques de patients de réanimation atteints de péritonite.

Intra-abdominal candidiasis in the critically ill patient is a pathology burdened with high morbidity and mortality. To date, it is not known whether this high mortality is directly attributable to Candida or whether the fact of isolating Candida in the peritoneal fluid is an indirect witness to the patient's underlying conditions (severity or comorbidities). One of the sources of controversy relates to the pathogen itself: the Candida yeast is a pathogen of the commensal flora of the digestive tract which gives it a colonizing status. Based on other clinical pathologies involving Candida, this premise requires an intact microbiota and immune protectives. We hypothesise that, during intra-abdominal candidiasis, Candida changes from a colonizing pathogen to an infecting pathogen under the influence of environmental stress (peritoneal fluid, coinfection with bacterias) and in the absence of eradicator immunity. The main objective of this resarch is to demonstrate the change in Candida status by a multimodal approach by looking for the morphology and growth (phenotype), the expression of the gene involved in its pathogenicity (molecular) and metabolic (heat production) from microbiological samples from critically ill patients with peritonitis.